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A、图A中只有一对等位基因，不能发生基因自由组合，A错误；
B、图B表示双杂合子自交，不能体现自由组合定律的实质，B错误；
C、图C中的两对等位基因位于同一对同源染色体上，不能自由组合，C错误；
D、自由组合的实质是在减数第一次分裂后期，非同源染色体上的非等位基因自由组合，D正确．
故选：D．
B、图B表示双杂合子自交，不能体现自由组合定律的实质，B错误；
C、图C中的两对等位基因位于同一对同源染色体上，不能自由组合，C错误；
D、自由组合的实质是在减数第一次分裂后期，非同源染色体上的非等位基因自由组合，D正确．
故选：D．
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分离与自由组合定律的现代学解释
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