张伟君的主要论著
1.《规制知识产权滥用法律制度研究》 专著，知识产权出版社。
2. 《知识产权与竞争法研究》 主编，法律出版社。
3. 《知识产权纵论》 副主编，知识产权出版社。
4.《中小企业知识产权经营手册》 合著，知识产权出版社。
5.《知识产权基础》 合著，上海社会科学出版社。
6.“迈克尔·乔丹起诉乔丹体育公司侵犯姓名权一案的法律评析”，载《电子知识产权》 ，2012年3月。
7.“ACTA关于‘数字环境下知识产权执法’规则评析”，载《知识产权》2012-年2月。
8.“知识产权执法的国际新标准以及我国的应对——以ACTA民事救济措施为例”，载《东方法学》 2012年6月。（被中国人民大学报刊复印资料全文收录）
9.“署名权等于作者身份权吗? 韩寒诉方舟子一案引发的思考”，载《电子知识产权》 2012年5月。
10.“贴牌加工产品的商标侵权问题研究”，载《2011沪台经贸法律论坛》。
11.“知识产权刑事保护门槛：从TRIPs到ACTA”，载《电子知识产权》2011年第8期。
12.“TRIPS协议与我国规制知识产权滥用法律制度的完善”，载《WTO法与中国论坛》文集——中国法学会世界贸易组织法研究会年会论文集（八），2009年9月11日。
13.“专利强制许可制度的合理性分析”，载《科学管理研究》2009年8月。
14.“TRIPS协议和我国专利强制许可制度的完善”，载《世界贸易组织动态与研究》2009年6月15日。
15.“从网络广播看我国网络传播著作权制度的完善”,载《信息网络安全》 2009年12月10日。
16.“试论著作权法对私人复制行为的规制”，载《知识产权》 2009年9月。
17.“规制知识产权权利人滥用诉权法律制度比较研究”（张伟君；单晓光），载《重庆工学院学报(社会科学版)》2009年2月。
18.“版权保护对信息获取的制约及其反垄断法规制”，载《信息网络安全》 2009年第2期。
19.“WTO框架下完善我国知识产权滥用规制制度的若干问题”，载《法学家》2008年第2期。
20.“知识产权保护对企业技术转让的影响”，载《知识产权》2008年第1期。
21.“论经济增长与知识产权制度的关系”，载《科学管理研究》2008年第2期。
22.“公共健康危机下的专利强制许可——对我国《专利法》第49条的修改建议”，载《电子知识产权》2008年第5期。
23.“滥用知识产权在中国《反垄断法》中的含义——对欧盟在TRIPS理事会提出的质疑的回答”，载《世界贸易组织动态与研究：上海对外贸易学院学报》2008年 第3期。
24.“维权还是扩权：这是个问题——再论录音制作者的广播权和表演权”，载《电子知识产权》2008年第1期。
25.“知识产权滥用的概念、表现和规制措施”，载《电子知识产权》2007年第12期。
26.“录音制品制作者的广播权和表演权应该缓行”，载《电子知识产权》2007年第7期。
27.“TRIPS协议对知识产权滥用的规制探析”，载《世界贸易组织动态与研究：上海对外贸易学院学报》2007年 第10期。
28．“卡拉OK：电影、录像还是音乐？”，载《知识产权》2004年第5期。
29.“TRIPS协议对我国知识产权许可反垄断立法的意义”，载《世界贸易组织动态与研究》 2003年6月15日。
30.“地名商标与地理标志冲突的法律调整”，载《中华商标》 2002年8月15日。
31.“完善行政赔偿程序刍议”，载《行政与法》2002年2月20日。
32．“我国技术进出口法律制度的新变化”，载《世界贸易组织动态与研究》，2002年4月15日。
33.“商标许可备案的简化与完善——浅析WIPO关于商标许可的联合建议草案”，载《中华商标》 2002年第2期。
34.“作为商业标识的药品商品名的法律保护”，载《科技与法律》 2002年3月
35.“版权信息扩张对信息获取的影响及其反垄断法的规制”，载《科技与法律》，2006年第1期。
36.“世界博览会标识权的特征”，载《中华商标》2006年第3期。
37.“知识产权许可反垄断法规制的不同模式和共同趋势” ，载《世界贸易组织动态与研究》2005年第1期。
38.“从欧盟判例看我国知识产权反垄断第一案”，载 《世界贸易组织动态与研究》2006年第4期。
39.“滥用专利权与滥用专利权制度辨析—从日本滥用专利的理论与实践谈起”（张伟君、单晓光），载《知识产权》2006年第6期。
40.“地名标志和地理标志冲突的法律调整 ”，载《中华商标》2002年第7期。
另外，在《中国知识产权报》发表评论文章多篇：
1.“科技创新需要知识产权全程服务”，《中国知识产权报》 2012年7月20日。
2.“荣誉非永恒,岂能成商标”，《中国知识产权报》2012年11月16日。
3.“美国大片增加进口量的版权释义”，《中国知识产权》2012年3月20日。
4.“构建全面、有效、平衡的知识产权保护体系”，《中国知识产权报》“论当前知识产权工作形势”系列评论之三2011年12月23日第一版“IP时评”。
5.“当雀巢遇上徐福记”《中国知识产权报》，2011年12月21日。
6.“迪斯尼的商业模式与中国文化创意产业的契机”，《中国知识产权报》2011年8月17日。
7.“奢侈品牌是怎样炼成的”，《中国知识产权报》2011年6月26日第04版。
8.“构建全面、有效、平衡的知识产权保护体系”，《中国知识产权报》2011年12月23日。
9.“警惕知识产权侵占公有领域”，《中国知识产权报》 2011年5月6日。
10.“学学迪斯尼打造品牌的生意经”，《中国知识产权报》 2011年8月17日。
11.“序列号‘钥匙’不该打开合法授权‘密室’”，《中国知识产权报版权周刊》，2009年12月18日。
12.“反垄断法规制知识产权权利滥用任重道远”，《中国知识产权报》 2007年9月12日。
13.“唱片公司争取广播权和表演权尚早？”，《中国知识产权报》2007年9月14日。
14.“中国高速列车走了一条怎样的创新之路？”，《中国知识产权报》2007年6月13日。
15.“强制许可，我们准备好了吗”，《中国知识产权报》 2005年11月23日。
