Question

如何对基因测序结果进行分析

Answer 1

可以用另一端的引物进行测序，从另一端测序可以一直测到序列的末端，就可以在序列的末端得到您的引物的反向互补序列。

如果想用你现有的数据找疾病相关的基因／通路／网络，出门直走差异表达分析。

首先，看测序峰图，如果结果的彩图显示峰型是尖锐单一的，碱基所对应的编码是一致的，那么可以判断序列是可以使用的。如果出现双峰，信号中断等异常现象，那么需要重新制备或者克隆后再测序。

一般情况系是通过荧光定量PCR，可以测定目的基因相对于标准基因的倍数，选取一定的基准，就能知道目的基因的数量。但是有时候由于DNA样本含量很少，会选用二代高通量测序的方法来检测染色体的倍数。

测序得到基因序列后一般都需要进行序列比对，看和目的序列的差异情况，常用的软件有DNAman，还有invitrogen的vectorVI也不错。此外还可以直接在网上进行比对，推荐NCBI网站的BLAST可以直接网上进行。

克隆至质粒载体中后集中测序〔9，10〕。sAGE的最终结果是通过计算机统计得到的，根据某个标签出现频率的高低来判断并计算其所属基因表达的丰度。