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A、基因突变是新基因产生的途径，A正确；
B、发生在生殖细胞中的基因突变可以遗传给子代，B正确；
C、杂合子和显性纯合子表现出的性状相同，因此基因重组所产生的新基因型不一定会表达为新性状，C正确；
D、染色体变异会引起基因数目和排列顺序的改变，但不会引起基因结构的改变，D错误．
故选：D．
B、发生在生殖细胞中的基因突变可以遗传给子代，B正确；
C、杂合子和显性纯合子表现出的性状相同，因此基因重组所产生的新基因型不一定会表达为新性状，C正确；
D、染色体变异会引起基因数目和排列顺序的改变，但不会引起基因结构的改变，D错误．
故选：D．
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