为什么清朝皇帝普遍不是由嫡长子继承?根本原因是什么？
根本原因是清朝的立储制度不是嫡长子皇位继承制，而是秘密立储制度。
清朝皇帝和历史上王朝一样实行世袭。太祖努尔哈赤之后的11帝都是他的子孙。但是袭位方式与历代不大同。历代由皇帝的嫡长子继位,并且要先预立为太子。清朝不守这个规矩,继位的不论是否皇长子,除了载淳外,无一是长子。
载淳曾有一弟,出生后未命名就死了,因此无人与他争王位。继位也不一定要先预立为太子。清朝的继位法几经变化。开始实行汗位推选继承制,太宗、世祖和圣祖都是由皇室贵族推选的。圣祖想效法汉族历代做法,开始立嫡长子允礽为皇太子,后来发现他不理想,又把他给废了。后来是皇四子胤禛争到了皇位。
鉴于过去几代皇子争位刀光剑影的残酷教训,世宗发明了一种秘密建储(储,储君,太子)法:把挑选出来准备继位的皇子姓名写好,放于匣中,置诸乾清宫正中顺治帝御书“正大光明”匾之后。皇帝死后,取出宣读,新君即位。这种办法用到道光。这段时间秘密建储也有中途改变的。
乾隆帝即位后立皇次子永琏为太子,乾隆三年永琏夭亡,乾隆帝改立皇十五子永琰(永琰后改为颙琰)。咸丰传位是临终召王大臣承写珠谕,立皇长子为皇太子。至于后来同治帝死后由载湉继位,是为光绪帝,光绪帝死后由溥仪继位,是为宣统帝,则是由慈禧太后懿旨确定的醇亲王载沣。
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背景
在我国封建社会中，按照封建宗法制原则，通常实行公开的嫡长子继承制。清代从康熙朝开始，沿用中原各王朝立嫡长子的做法确定皇位继承人。康熙十四年（1675年）下诏册立嫡长子胤礽为皇太子。
康熙帝多子，在位时间又长，过早地公开册立太子，造成了康熙帝和太子间、太子和诸皇子间的矛盾和纷争。矛盾激化到不可调和的地步，使皇权受到了威胁，政局也因此动荡不宁，康熙帝不得已两次废皇太子胤礽。
从康熙五十一年(1712年)第二次废皇太子后，康熙皇帝再没有公开建储，致使康熙死后雍正帝即位成为一大历史疑案。一说雍正帝遵遗诏即位，即康熙帝临终前，遗诏雍亲王皇四子胤禛“克承大统”。
一说雍正帝“矫诏篡位”，即康熙帝临终前遗诏“皇位传十四子胤祯”(皇十四子胤禵原名胤祯)，皇四子胤禛将“十”改为“于”，将“祯”改为“禛”，于是康熙帝遗诏就成为“皇位传于四子胤禛”。
无论历史真相如何，雍正帝虽是康熙朝激烈的皇位争夺战中的胜利者，然而，争夺战的严重后果给予雍正的教训是深刻的，因而在即位后，他断然废弃了公开建储制，宣布实行秘密建储。
雍正元年(1723年)八月，雍正帝于乾清宫西暖阁召见王公大臣时宣布：“今朕诸子尚幼，建储一事，必须详加审慎，此事虽不可举行，然不得不预为之计。
今朕特将此事，亲写密封，藏于匣内，置之乾清宫正中，世祖章皇帝御书‘正大光明’匾额之后，乃宫中最高之处，以备不虞，诸王大臣咸宜知之。”雍正帝命诸王大臣共议这种做法，诸王大臣均无异议。
雍正帝遂命诸臣退下，只留总理事务王大臣当面将密封的锦匣收藏于“正大光明”匾后。后来，雍正帝又另书密封一匣，“常以随身”。
参考资料来源：百度百科-密建皇储
参考资料来源：百度百科-秘密立储制度
根本原因是清朝的立储制度不是嫡长制，而是秘密立储制度。
清朝建立以来，在皇位传承上一直在不断地探索，前朝的经验固然可以借鉴，但弊端也是显而易见的：嫡长制虽可避免兄弟之争，但不能保证选优。
太子制则容易引起皇室内部倾轧，骨肉相残。因此，怎样立储、怎样传位，也是皇帝深感伤脑筋的一件事情。
清初是其建立政权、平定叛乱、恢复经济、巩固统治的关键时期，但皇权斗争也始终没有停止过，即使像康熙这样英明的皇帝，也被皇子之间你死我活的竞争弄得心力交瘁。
于是，雍正帝即位后，吸取了历代围绕预立太子发生的皇子、后妃之间为争储位明争暗斗、倾轧不休、骨肉相残、造成混乱的教训，以及自己争夺皇位的亲身经历，创立了秘密立储制度。
从此，不再公开立皇太子，而是秘密立储，直到自己驾崩之后，由谁来继承皇位才真相大白。具体方法是：由皇帝亲书立储谕旨一式两份，一份密封在锦匣内，安放于乾清宫“正大光明”匾后，另一份皇帝自己保存。
待皇帝驾崩时，由御前大臣将两份遗旨取出，共同拆封，对证无误后当众宣布由谁继位。雍正就是用这种新的制度选立了乾隆皇帝。
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清朝唯一以嫡长子身份继承皇位的皇帝：
清宣宗爱新觉罗·旻宁（1782.9.16—1850.2.25），原名绵宁，即位后改为旻宁。是清朝第八位皇帝，也是清朝定都北京后的第六位皇帝。
是清朝唯一以嫡长子身份继承皇位的皇帝。嘉庆皇帝第二子，母为孝淑睿皇后喜塔腊氏，生于乾隆四十七年（1782年）九月十六日。
旻宁在位期间，整顿吏治，整厘盐政，通海运，平定张格尔叛乱，严禁鸦片，力行节俭，勤于政务，但其才略有限，社会弊端积重难返。
道光二十年（1840年）中英鸦片战争爆发，中国战败，被迫于道光二十二年（1842年）签订丧权辱国的《南京条约》，此后八年旻宁苟安姑息、拒绝变革，而内忧外患日益严重，太平天国运动也已在酝酿之中，清王朝陷入危机。
道光三十年（1850年）正月十四日驾崩。在位30年，终年69岁。庙号宣宗，谥号效天符运立中体正至文圣武智勇仁慈俭勤孝敏宽定成皇帝，葬于清西陵之慕陵，传位第四子奕詝。
参考资料来源：百度百科——爱新觉罗·旻宁
参考资料来源：百度百科——秘密立储制度
其方法是皇位世袭制度，即秘密建储。其方法是皇帝亲写立储谕旨一式两份。一份封藏于匣中安放在乾清宫中“正大光明”匾额之后，另一份则由皇帝保存。待老皇帝死后，大臣们将在两份谕旨取出对证无误，新皇帝是何人方才揭晓。雍正帝就是用这种新的秘密建储制度立皇四子弘立为太子。雍正死后，弘立即位，是为乾隆。
乾隆也曾两次以此法立储，一次是1736年(乾隆元年)选立的储君永琏在三岁就死了。第二次是1773年，所立储君就是后来的嘉庆皇帝。以后的嘉庆、道光也均以此法建储。至咸丰时，因国事纷扰，又只有一子，故无须秘密立储，不久病死于避署山庄。同治、光绪均无子嗣，不需要立储，秘密立储制度遂告终结。
