我认为更确切点来说，宫崎骏动画的主角多为少女角色，单纯美好而又令人心动。
个人认为，原因可能有二：一是创作者的主观意愿，二是出于服务受众的需要。
下面稍微展开谈谈：
首先是创作者的主观意愿。
编剧家悉德•菲尔德说过：
“人物是电影剧本的根本基础，它是故事的心脏、灵魂和神经系统。"
从《风之谷》的娜乌西卡，《天空之城》的希达，再到《幽灵公主》的珊以及后来的《千与千寻》中的荻野千寻，在这些我们熟悉的宫崎骏的作品中，我们可以发现：惟一具有广泛共性的事物便是少女。《红猪》似乎是个例外，但只要是看过《红猪》的人，想必会对剧中冈村明美配音的机械师菲奥・保可洛印象深刻。
“男人和女人曾为一体,后来被宙斯分成两半,因此他们出生后都要寻找另一半来获得完整。”
在生物学上，“双性同体”指的是体型构造和生理特征的两性混合：在心理学上,“双性同体”指同一个体既有明显的男性人格特征,又具有明显的女性人格特征,即兼有强悍和温柔、果断与细致等性格。双性同体所暗示的对男女性别界限的模糊和包容，恰恰解构了传统父权社会二元对立的思维模式。而宫崎骏动画作品中的少女大都体现了这种“双性同体”的人格特征。
参考楼上 @金燕宁 同学的回答，2009年宫崎骏在加州大学伯克利分校（UC Berkeley）日本研究中心参加访谈时说过：
“……鉴于如今有这么多强大的女性，我可能得开始考虑制作关于男性的影片来鼓励鼓励他们了！”由此可见，宫崎峻的动画作品中主角多为“坚强，独立，有好奇心和理想的年轻女性”，很可能是出于对女孩（尤其是日本女孩）的鼓励。
宫崎骏的动画电影中把女性形象（多是少女形象）放在了中心地位，无论能力还是行为表现往往都强于身边的男性，这在日本动画片中是不多见的，主流类型的动漫作品《灌篮高手》、《圣斗士星矢》、《七龙珠》、《火影忍者》等等，都把幻想集中到了男性身上，显然男性在故事中占据主体地位是对日本现实社会的真实映射。
”在日本这样一个男权至上的传统社会中，宫崎骏的作品似乎是在为女性主义张目，他笔下的一个个纯洁、勇敢、高尚的美丽少女征服了整个世界。“（《感受宫崎骏》，秦刚 ，文化艺术出版社，2004年）
除此之外，了解宫崎骏的人都知道，他并不是一个乐观的人。
而少女，也正是人性中注定要失去的令人向往的纯真的象征。
……
然后，再来谈谈服务受众的需要。
英国影评人、女性主义电影理论家劳拉·穆尔维有一个著名的论断：“看本身就是快感的源泉。”
电影怎样迎合并利用社会中既定的欲望、幻想、恐惧体系的问题，在劳拉·穆尔维的《视觉快感和叙事电影》一文中得到了公认为最有意义的处理：
“在一个由性的不平衡所安排的世界中，看的快感分裂为主动的男性和被动的女性。起决定性作用的男人的眼光把他的幻想投射到照此风格化的女人形体上。女人们在她们那传统的裸露癖角色中同时被人看和被展示，她们的外貌被编码成强烈的视觉和色情感染力，从而能够把她们说成是具有被看性的内涵。……主流电影干净利落地把奇观和叙事结合了起来。在常规的叙事影片中，女人的出现是奇观中不可缺少的因素。”
劳拉·穆尔维也指出：
“电影提供若干可能的快感。其一就是观看癖。正如相反的形态，被看也是一种快感。”
可以这么说，作为作品的造物者，宫崎骏本人是十分矛盾的，在个人情感上他极大地倒向了象征着纯真善良的女性，但是先天性别的差异也在一定程度上影响到了他的个人创作。在2014年，就曾有过日本漫画家江川达也在电视节目节目上发声批评宫崎骏，称他将暴力与色情因子巧妙隐藏在动画内，此番冲击性的发言引起了极大争议。（新闻源：日漫画家批宫崎骏动画暗藏色情：“很危险”）
而事实上，在现代日本社会中，宫崎骏动画中那一类纯情少女已经很难再见到了，宫崎骏的作品中女孩子的纯洁得到了日本现代社会的认同，正是源于日本传统的男权社会对女性纯洁缺失的呼唤。男性观众在观看电影的同时，通过对女性主人公的认同达到了一种渴望纯情少女的满足。而女性观众也通过对女主人公的认同的同时，不知不觉地认同了男性对女性的标准。
这与法国著名哲学家、“结构主义马克思主义”的奠基人路易斯·阿尔都塞(Louis Althusser)所持观点相似，广大受众们通过对宫崎骏作品女性形象的认同来认同男性社会法则的这一行为，而正是一个男权社会意识形态把“个体询唤为主体”的过程。
