玄武门之变后，秦琼被降职，这是为什么呢？
秦琼在投奔李唐之后，李渊让其跟随李世民，深受李世民敬重；授职位马军总管，跟随李世民共同镇守长春宫。跟随李世民在美良川击败尉迟敬德，秦琼功最居多；被李渊遣使赐以金瓶，拜为秦王府右三统军。
跟随李世民在介休破宋金刚，秦琼再次被赐黄金百斤、杂彩六千段，加封上柱国。在讨伐王世充时，秦琼每为前锋；在武牢关拒窦建德时，秦琼以数十精骑率先冲陷对方阵营；王世充平定后，秦琼进封翼国公，赐黄金百斤、帛七千段。跟随李世民平定刘黑闼后，秦琼被再次获得许多物资赏赐。从上面可以看出，秦琼在玄武门之变前是经常跟随李世民东征西讨，可谓秦王府骁将，爵位为翼国公。
玄武门之变后，拜左武卫大将军，食实封七百户。其后旧伤复发，于贞观十二年病逝，追赠徐州都督，陪葬昭陵。李世民在其墓前立石人石马，以表彰战阵之功；贞观十三年，改封胡国公；贞观十七年，也就是去逝后六年，被李世民图形于凌烟阁二十四功臣之列，以供自己怀念，后人景仰。
秦琼早期长期戎马倥偬，负伤累累，后期伤病复发，才致使其战力下降，玄武门之变后再没有出战沙场。《旧唐书》记载，秦琼经常对人说：“吾少长戎马，所经二百余阵，屡中重疮。计吾前后出血亦数斛矣，安得不病乎？”这就说明秦琼受伤已经伤及内腑，多次吐血，身体已经严重透支了。
据史料记载，秦琼就是属于单挑型骁将，难怪能够负伤累累。每次跟随李世民征战，当遇到对方有骁将叫阵时，李世民就会命秦琼出马应战，每次秦琼都是跃马负枪而出，在万军之中刺杀对方将领。李世民更加重视秦琼，秦琼也为此非常自豪。
玄武门之变后不久，秦琼突然卧病在床，李世民特意派太医前去诊治，并赠送了许多贵重的药材，家人将煎好的药递给秦琼，却被他一把倒掉：“这些药不能吃！”家人们吓得魂飞魄散，难道皇帝要对秦家下手？秦琼作战十分勇猛，年轻时，在隋将来护儿帐下效力。
太医诊断后，知道秦琼并无大碍，就如实禀报李世民，李世民何等睿智，立刻心知肚明，既然秦琼有心退出朝政，那就如他所愿。当然，秦琼也不会真的吃药，万一吃出问题来，得不偿失。所以，就算皇帝送的药，也一律倒掉。
病了漫长的十二年后，秦琼寿终正寝，李世民追封他为胡国公，陪葬昭陵，在他墓前立起石造人马，还将画像挂入凌烟阁，用以表彰其赫赫战功，哀荣至极。秦琼不但作战勇猛，而且有情有义，但凡重用过他的人，他都竭力辅佐，甚至不顾一切地救对方于危难之中，投奔李世民后，更是英勇奋战，战无不克，为大唐的一统天下立下汗马功劳。天下安定后，他却急流勇退，大智若愚，令人敬佩不已。
