马来西亚航空公司的重大事故
波音737-200被劫持坠毁事故
1977年12月4日 ，一架波音737-200（注册编号9M-MBD）执行从槟城飞往吉隆坡的马来西亚国内航空653号班机时，在马来西亚柔佛州遭劫持，坠毁于丹绒古邦，机上100人全数遇难。
空中客车A300坠毁事件
一架空中客车A300（注册编号OY-KAA，租自北欧航空）执行新加坡飞往吉隆坡的马来西亚航空684号班机，在降落吉隆坡梳邦机场时坠毁，无人遇难。
福克50失误坠毁事故
一架福克50（注册编号9M-MGH）执行马来西亚航空2133号班机，在斗湖降落时因机师失误坠毁，34人遇难。
MH3002事故
马来西亚航空公司全资子公司飞翼航空一架从该国沙巴至古达的飞机（航班号为MH3002）在古达机场发生事故，飞机坠机时撞上一家民宅。机上副驾驶员和一名乘客遇难，4名旅客受伤。
MH370客机失联事故
2014年3月8日，马来西亚航空公司一架航班号为MH370的波音777-200ER客机从吉隆坡飞往北京，计划北京时间6：30抵达北京首都国际机场，却在凌晨1：20分失去联系。飞机最后的消息来自南海海域。 2014年3月8日，据美国有线新闻网（CNN）报道，一架越南搜救飞机8日在马来西亚和越南交界海域发现疑似失事飞机的油污和碎片，但是被否认油污和碎片是马航飞机的物品。2014年3月24日，MH370被证实坠入南印度洋。人员全部遇难。
2015年1月29日，马来西亚交通部称，经327天搜寻还未寻获MH370，马来西亚民航局局长阿兹哈鲁丁表示，根据《国际民航公约》规定，确定马航MH370航班正式失事。2015年8月份，在法属留尼汪群岛发现了MH370的部分残骸。
MH066迫降香港
2014年3月24日马来西亚航空公司宣布，原定从吉隆坡飞往韩国首都首尔的MH066航班出现电子故障，当天早晨转降香港。马航在一份声明中说，这架MH066航班使用空中客车公司的A330-300，由于提供电力的常规发电机失效而转飞香港。不过，后备电源单位继续供电。那架飞机当天早晨平安降落香港，机上271名乘客已经转乘其他航空公司的航班。
MH17事故
乌克兰总统波罗申科称，一架载有298人（15名机组人员）的民航客机于北京时间2014年7月17日23时在俄乌边境地区被击落坠毁（包括3名婴儿），机上无一人生还。该飞机系为马来西亚MH17航班。客机机型为波音公司生产的波音777-200型客机，坠毁原因疑为飞行员节省燃料抄近道误进军事演习区被演习导弹击落。
MH148紧急迫降
2015年6月12日路透社报道，当日，马来西亚航空公司一架客机在起飞后不久发动机火灾警报响起，飞机被迫返航并在墨尔本机场紧急着陆。所有乘客安全离开客机。据报道，这架航班号为MH148的空客A330共载有300名乘客，计划从澳大利亚墨尔本飞往吉隆坡。
MH388紧急更换飞机
2015年7月31日早9时从吉隆坡国际机场飞往上海浦东的MH388班机在准备起飞时出现技术故障，因而决定将班机延至下午4时15分起飞。此间《星洲日报》报道，一名网民针对此事在脸书不满发文称，他所乘坐的马航MH388班机在准备起飞前惊传“砰”的一声巨响，随即乘客被告知，因为飞机一个引擎出现故障而引发“巨响”。 马航发表声明说，出现技术问题的班机目前已送往检查，并将即刻进行维修工作；马航更换另一架班机执行飞行任务，该机于31日晚9时20分抵达上海浦东。
MH19紧急迫降印度
2015年9月3日，马来西亚航空公司一架飞行MH17航线的客机，因为飞机上马桶失灵，飞行途中要转飞印度降落。马航发言人说，航班编号已改为MH19的客机，在阿姆斯特丹飞往吉隆坡途中，改在印度清奈（Chennai）降落，稍后才飞返吉隆坡。
MH132飞错航线
2015年12月25日，马航MH132航班当地时间25日凌晨大约2时20分从新西兰北部的奥克兰机场起飞，前往马来西亚首都吉隆坡。起飞后，飞错航线，向几乎相反方向飞行。按照马航发给飞行员的飞行计划，飞机本应直接向西北方向飞行。按照程序，马航应把飞行计划事先送交奥克兰机场地面航空管制人员，由后者向飞行员发出飞行指令并把航线输入飞机的电脑系统。但是起飞后，飞机航向却向西偏南，向澳大利亚东南部城市墨尔本飞去。升空后大约8分钟，MH132航班的飞行员发现，马航提供的飞行计划与奥克兰机场提供的飞行计划不一致，随即询问机场飞行管制人员。飞行员与机场方面沟通后，后者修正了航线程序。
MH002紧急迫降后乘客暴毙
2016年3月30日，马航MH002班机本月27日晚间11时47分起飞后，原订28日下午1时抵达达希思罗机场，不料途中遇上正侵袭英国的凯蒂风暴(StormKatie)，被迫改道前往曼彻斯特机场。班机在曼彻斯特机场滞留三小时后，客机宣布一名乘客在机上暴毙，因此必须寻求紧急医药援助，结果又延误两个小时。有消息指出乘客在机舱内苦等五小时，马航却没有任何交代，也没提供食物和其他援助，这引起乘客强烈不满。
