基因结构
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编码区: 不连续的基因结构,包含外显子和内含子,它们交替出现。CDS序列以ATG开始,起始密码子只有这一个,并且在外显子中。
(1)外显子: 编码区中不连续的具有蛋白编码功能的DNA序列。第一个外显子的头部是蛋白翻译的起始密码子;最后一个外显子的尾部是终止密码子。
(2)内含子 :编码区中外显子之间间隔的非编码序列。
(3)开放阅读框(ORF): 从DNA的起始密码子(ATG)到终止密码子(TAA、TGA、TAG)的碱基序列,且不包含终止密码子。
非编码区 :又叫侧翼序列(flank),是编码区第一个外显子和最后一个外显子之间以外的区域,这个区域中包含了启动子、终止子、增强子等调控元件。一个基因中有外显子和内含子,但是基因和基因也不是连续的,它们之间的区域就不是内含子了,而是叫做 基因区间 ,同样属于非编码序列。
(1)上游侧翼: 第一个外显子以外的序列,包含启动子区域。
(2)下游侧翼: 最后一个外显子以外的序列,包含终止子序列。
首先在最后一个外显子的终止密码子下游有一个AATAAA序列,这个序列主要参与mRNA 的 多聚腺苷酸化 过程。多聚腺苷酸化就是得到polyA尾巴之前,mRNA的3'端会水解掉10-15个碱基。这个序列的作用就是作为RNA裂解的信号,指导核酸内切酶在此信号下游10~15碱基处裂解 mRNA。之后就是聚合酶作用使得3'端加上polyA变成成熟mRNA。
AATAAA序列再往下到转录终止位点(TTS)之前,是一个 反向重复序列 (7-20个碱基对),转录后形成一个发卡结构,可以阻碍RNA聚合酶移动,终止转录。
注意: 起始密码子和终止密码子都在外显子上,位于编码区;但是,转录起始位点TSS和转录终止位点TTS都在非编码区,TSS在启动子区下游&起始密码子上游,TTS在终止子区下游&终止密码子下游。
RNA进化过程中的结构变化
(1)pre-mRNA → mature mRNA: pre-mRNA(前体mRNA)就是从转录起始位点TSS到终止位点TTS,还需要进行内含子剪切,5'加帽子结构,3'加PolyA修饰,才可以形成成熟mRNA。
(2)mature mRNA: 包括编码区、5'UTR、3'UTR、5'帽子结构、3'polyA尾。
(1)外显子: 编码区中不连续的具有蛋白编码功能的DNA序列。第一个外显子的头部是蛋白翻译的起始密码子;最后一个外显子的尾部是终止密码子。
(2)内含子 :编码区中外显子之间间隔的非编码序列。
(3)开放阅读框(ORF): 从DNA的起始密码子(ATG)到终止密码子(TAA、TGA、TAG)的碱基序列,且不包含终止密码子。
非编码区 :又叫侧翼序列(flank),是编码区第一个外显子和最后一个外显子之间以外的区域,这个区域中包含了启动子、终止子、增强子等调控元件。一个基因中有外显子和内含子,但是基因和基因也不是连续的,它们之间的区域就不是内含子了,而是叫做 基因区间 ,同样属于非编码序列。
(1)上游侧翼: 第一个外显子以外的序列,包含启动子区域。
(2)下游侧翼: 最后一个外显子以外的序列,包含终止子序列。
首先在最后一个外显子的终止密码子下游有一个AATAAA序列,这个序列主要参与mRNA 的 多聚腺苷酸化 过程。多聚腺苷酸化就是得到polyA尾巴之前,mRNA的3'端会水解掉10-15个碱基。这个序列的作用就是作为RNA裂解的信号,指导核酸内切酶在此信号下游10~15碱基处裂解 mRNA。之后就是聚合酶作用使得3'端加上polyA变成成熟mRNA。
AATAAA序列再往下到转录终止位点(TTS)之前,是一个 反向重复序列 (7-20个碱基对),转录后形成一个发卡结构,可以阻碍RNA聚合酶移动,终止转录。
注意: 起始密码子和终止密码子都在外显子上,位于编码区;但是,转录起始位点TSS和转录终止位点TTS都在非编码区,TSS在启动子区下游&起始密码子上游,TTS在终止子区下游&终止密码子下游。
RNA进化过程中的结构变化
(1)pre-mRNA → mature mRNA: pre-mRNA(前体mRNA)就是从转录起始位点TSS到终止位点TTS,还需要进行内含子剪切,5'加帽子结构,3'加PolyA修饰,才可以形成成熟mRNA。
(2)mature mRNA: 包括编码区、5'UTR、3'UTR、5'帽子结构、3'polyA尾。
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