Question

试比较经典鉴定方法和采用16SrRNA序列进行鉴定的优缺点

Answer 1

问：试比较经典鉴定方法和采用16SrRNA序列进行鉴定的优缺点

答：细菌的分子鉴定，需要我们选择什么样的一段DNA分子呢？他必须符合几个特点：1. 在所有菌株中都存在，要不没法比（最好在所有物种中都存在或者相近的存在）；2. 在进化中相对保守，执行相同或相近的功能；（执行相同的功能才能在进化压力下相对保守，只有相对保守，有一个稳定的架构才能比较亲缘，要不然鸡跟鸭没法比）3. 有一定的信息量，序列太短了信息量太少，无法很好的比较；4. 便于序列分析，（别太长了，太长了增加技术难度和准确性）核糖体是在所有细胞形式生命中都存在，而且功能相同（合成多肽链）。所以核糖体rRNA的DNA序列相对保守，是较理想的进化、亲缘分析的对象。其中5S rDNA太短信息量不足，；16S rDNA一般有1.5 kbp够长了；而23S rDNA太长不便分析；所以一般我们都是以16S rDNA作为菌株鉴定的分析对象