在开展某个基因的功能研究时,如该基因编码的蛋白是一个转 录调控因子。请问如何确认该 转录调控因子调控哪些靶标基因?以及如何鉴定该转录调控
因子结合在靶标基因启动子上的位置(结合的DNA基序)?
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确认一个转录调控因子调控哪些靶标基因,可以采用以下几种方法:1. 基因芯片(microarray):通过对大量的靶基因进行同步检测,筛选出与该转录调控因子有关联的基因。2. RNA干扰技术(RNAi):通过对目标基因和该转录调控因子进行RNA干扰,观察基因表达水平的变化,以确定该转录调控因子是否影响了该基因的表达。3. 良性突变体分析:观察良性突变体在发育过程中所表现出来的表型,并比较正常体的表型,从而推断出该转录调控因子所调控的靶标基因。鉴定一个转录调控因子结合在靶标基因启动子上的位置,可以采用以下几种方法:1. 染色质免疫沉淀技术(ChIP):通过利用抗体识别该转录调控因子,从而将该因子结合的DNA序列进行纯化和富集。然后可以使用PCR或者测序技术来鉴定富集的DNA序列,从而确定该转录调控因子结合在靶标基因启动子上的位置。2. DNA足迹分析(DNase footprinting):通过利用DNA酶对某个区域进行消化,从而得到该转录调控因子结合的特定序列。然后可以使用PCR或者测序技术来鉴定富集的DNA序列,从而确定该转录调控因子结合在靶标基因启动子上的位置
咨询记录 · 回答于2023-04-18
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还有么
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