判断消毒灭菌是否彻底的主要依据是芽孢被完全消灭。
芽孢又称内生孢子,是细菌休眠体,某些细菌在其生长发育后期,在细胞内形成的一个圆形或椭圆形,厚壁,含水量低,抗逆性强的休眠体构造,称为芽孢。在不同细菌中,芽孢所处的位置不同,有的在中部,有的在偏端,有的在顶端,芽孢一般呈圆形、椭圆形、圆柱形,在有些细菌中,芽孢的直径小于菌体直径。
芽孢的结构相当复杂,最里面为核芯,含原生质体,被芽孢膜所包裹。核芯外面为皮层,成分为肽聚糖,再往外是一层或数层蛋白质组成的芽孢壳,最表面为芽孢壁,也称芽孢外壁。由于芽孢在结构和化学成分上均有别于营养细胞,所以芽孢也就具有了许多不同于营养细胞的特性。