吴铭能的著作目录
2001.2，《梁启超研究丛稿》，台湾学生书局，407页。
2005.12，《梁启超的古书辩伪学》（收在《古典文献研究辑刊·初编》第21册），台北花木兰文化出版社，92页。
2007.4，《数风流人物》，台北秀威资讯公司，160页。－梁启超、徐志摩、陈独秀、雷震
2009.2，《书评写作方法与实践》，台湾秀威图书公司。
2010年6月第1版，《历史的另一角落－－档案文献与历史研究》 商务印书馆 。
（即出），《艺道情：王庆余大师口述传奇的一生》 2008.2，〈档案、校勘与历史真相：以黄彰健着《二二八事件真相考证稿》为例〉，《海峡评论》，第206期，页57-64。
2007.12，〈晚清满汉冲突与省籍情结：以试释王湘绮〈督抚歌〉为中心的观察〉，《儒藏论坛》第二辑，页420-438。
2003.7，〈读国防部档案选辑“雷震案史料汇编”〉，《古今论衡》第9期，页125-142。
2002.07，〈台静农先生珍藏陈独秀手札的文献价值〉，《古今论衡》第8期，页18-41。
2002.3，〈关于蔡松坡史料二三事─首次公布梁启超亲笔文稿〉，《书目季刊》第35卷第4期，页59-65。
2000.6，〈北京大学收藏‘梁启超给蹇季常等书信’书后─兼谈书信的文献价值〉，《书目季刊》第34卷第1期，页83-97。
1998.3，〈君子合而不同─记熊十力与马一浮的一次冲突〉，《中国文哲研究通讯》第8卷第1期，页119-126。
1997.6，〈梁任公先生与饮冰室收藏书籍题跋〉，《国家图书馆馆刊》第86卷第1期，页227-244。
1997.5，〈困勉志大人之学─曾文正对梁任公的影响〉，《鹅湖》第22卷第11期，页32-36。
1996.3，〈一篇湮没七十余载的重要佚文─首次发表‘梁启超对于顺天时报启事’原稿〉，《北京大学学报》(哲学社会科学版)第33卷第2期，页87-90。 吴铭能。1995.12，〈梁启超对国学的新解─兼谈梁氏肯定中国文化价值的心路历程〉，《鹅湖》第21卷第6期，页49-56。 2005年11月4-5日，〈从中研院近代史研究所“口述历史”文字之更动见历史研究的若干问题─以高雄地区二二八事件为例〉，中央研究院近代史研究所主办，“记忆载体与近代中国的认同建构”(Vehicles of Memory and the Construction of Modern Chinese Identities)学术研讨会，16页。
2004年12月16-17日，〈由“高中历史课程纲要”之争论见台湾的认同危机〉，澳门大学社会及人文科学学院当代中国社会科学研究中心主办，“国家认同与两岸未来国际研讨会”，10页。
2004年6月29日，〈专明学术以济天下─陈澧经学发微〉，中央研究院文哲所主办，“广东学者的经学研究第一次学术研讨会”，18页。
2003年11月28日，〈论王湘绮论章实斋〉，淡江大学、汉学研究中心合办，“第四届文献学术研讨会─文献的学理与应用”。收在陈仕华主编、林惠珍编辑《章学诚研究论丛：第四届中国文献学学术研讨会论文集》，台北：台湾学生书局，2005年2月，页243-280。
2001年5月3-4日，〈五四新文化运动一代表性刊物《新潮》之研究〉，收在郝斌、欧阳哲生主编《五四运动与二十世纪的中国：北京大学纪念五四运动80周年国际学术研讨会论文集》，北京 : 社会科学文献出版社，页-。
1999年11月19-21日，〈梁启超清代学术史述评〉，收在国立中山大学清代学术研究中心编《清代学术论丛》第三辑，页421-452。
专题研究之一部分
2003.8，〈台静农先生珍藏陈独秀手札的文献价值〉，《陈独秀研究》第二辑，合肥：安徽大学出版社，安徽大学陈独秀研究中心、安徽省陈独秀研究会编，页158-192。 2007.7，〈读沈津《顾廷龙年谱》〉，《古今论衡》，第16期，页161-178。
2004秋季，〈归骨于田横之岛─评王泛森着Fu Ssu-nien: A Life in Chinese History and Politics〉，《九州岛学林》第2卷第3期(总5辑)，页370-379。
2003.6，〈评沈津着“翁方纲年谱”〉，《汉学研究》第21卷第1期，页461-467。
2001.6，〈评刘达临着《中国性史图鉴》〉，《汉学研究》第19卷第1期，页427-434。
张锦郎、吴铭能。2001.3，〈评介辛广伟着《台湾出版史》〉，《书目季刊》第34卷第4期，页63-87。
1999.12，〈沈津着《美国哈佛大学哈佛燕京图书馆中文善本书志》校读书后〉，《国家图书馆馆刊》第88卷第2期，页65-76。
1999.6，〈《北京大学图书馆藏善本书录》读后记〉，《古今论衡》第2期，页97-103。
1996.5，〈学术的良知与严谨─梁启超“年谱”和“手迹”校读感言〉，《北京大学学报》(哲学社会科学版)第33卷第3期，页26-28。 2006.12，〈把四川大学古籍所建设成宋代文献资料中心：曾枣庄教授谈《全宋文》编纂经过〉，《国文天地》第259期，页102-106。
2006.7，〈岂仅仅是一张文凭而已－台湾不承认大陆学历的分析〉，《海峡评论》第187期，页37-39。
2006.3，〈沈津着《翁方纲年谱》暨辑《翁方纲题跋手札集录》补遗〉，《中国文哲研究通讯》第16卷第1期，页129-151。
2005.6，〈广东学术文化遗址考察记〉，《中国文哲研究通讯》第15卷第2期，73-93页。
2005.1，〈评民进党族群多元国家一体决议文〉，《二十一世纪》网络版总34期。
2005.1，〈少了逗点 大有不同─陈独秀自传写作日期辨正〉，《明报月刊》第四十卷第一期，页18-19。
2004.3，〈晚清“湖湘经学研究”座谈会纪录〉，《中国文哲研究通讯》第14卷第1期，页3-42。
2003.9，〈“台静农先生珍藏书札(一)试读(下)”〉(附：《台静农先生珍藏书札(一)》试读后记)，《中国文哲研究通讯》第13卷第3期，页171-201。
2003.6，〈“台静农先生珍藏书札(一)试读(中)”〉，《中国文哲研究通讯》第13卷第2期，页245-272。
2003.3，〈“台静农先生珍藏书札(一)试读(上)”〉，《中国文哲研究通讯》第13卷第1期，页141-191。
2002.8，〈关于陈独秀自传写作时日辨正〉，《历史月刊》第175期，页113。
1997.10，〈今本《饮冰室合集》未收梁任公文字知见举要〉，《梁启超研究》第13期，广东：新会市梁启超研究会编印。
