Question

你好，想请教一下，DEG测序跟转录组测序的区别是？觉得转录组测序好像也能检测出表达异常的基因。

数字基因表达谱DGE测序技术是过去式吗？现在应用情况还多吗？什么情况下用DGE测序更合适？

Answer 1

都是用二代测序的技术来对RNA进行测序，但实验目的和前期样本处理是不同的。
转录组测序，是指对样本的mRNA或者非编码RNA进行二代测序，可以获得转录本基因的表达量以及不同样本间的表达量的差异，还可以研究转录本基因的结构，研究可变剪切，也可以发现新的转录本。
而DGE的话，只是用于获得转录本的表达量。前期处理使用酶切的方法切下一段tag序列，然后进行二代测序，用这些tag的量来代表表达量。
以前DEG技术的存在是因为其测序量小，节省成本，但是现在转录组测序的成本也变得很低，DEG技术基本上没有什么优势了。现在大多测序公司已经不接DEG测序了，直接转录组测序，因为价格差不多少。