Question

基因组提取实验中,是否会有细菌基因组的污染?为什么

Answer 1

在基因组提取实验中，细菌基因组的污染是普遍存在的，原因主要有以下几个方面：

样品来源：很多生物样品来源于自然环境或身体内部，例如土壤、水体、食物、动物组织和血液等，这些样品中都可能存在着细菌群落和污染，这就会带来一定的细菌基因组污染。

试剂污染：基因组提取需要使用一系列的试剂和培养基，这些试剂和培养基使用不当、来源不清等因素都可能会导致细菌基因组的污染，等到PCR扩增的时候出现模板的偏移。

操作环境：在进行基因组提取实验的过程中，操作员的动作和空气中的菌落也可能带来一定的细菌基因组污染。操作员呼出的气体或在操作中飞散的颗粒会有挥发的细菌，这些都可能在实验过程中污染样品。

细菌基因组的污染不仅会影响到提取到基因组的纯度和质量，还会导致RNA测序的顺利进行等后续实验的结果受到影响。为了避免细菌基因组污染，应该采取以下措施：

选择干净、无菌的试剂和工具，并在实验室操作中保持清洁；

样品来源方面，减少环境、空气和人为带菌的污染，选用新鲜并经过过滤或纯化处理过的样品；

采用防污染措施，例如使用手套、口罩和实验室空气净化器等。

综上所述，在基因组提取实验过程中难免会出现细菌基因组的污染，需要在实验中严格控制和防范，尽量降低影响，并采取更多的防护措施以保护试验的结果和数据真实可靠性。