Question

琼脂糖电泳能检测50bp的DNA吗？

能用琼脂糖电泳检测的50bpDNA条带吗？我用过2%的胶，80V电泳。Mark是PBR322/Mspl,电泳了90分钟，Mark还没跑开。我都先后看了30分钟，60分钟，90分钟的电泳效果图，都没有目的条带（点样2ul）。像这种短片段DNA能用琼脂糖电泳检测吗？琼脂糖浓度为多少？电泳多长时间？DNA的点样量有什么要求不？是不是有什么操作诀窍？请大家帮帮忙啊。。。

Answer 1

没有问题，我就跑过。2%-2.5%的琼脂糖，电泳100V,35-40分钟左右，不要跑太长，90分钟肯定跑出去了。

点样前先测一下你的样本浓度，DNA上样总质量小于50ng肯定看不到，50bp的样本质量很小，所以需要高浓度样本。

其次，电泳前在胶下端缓冲液再均匀加入5ul左右二溴乙锭，由于ethidium bromide带有少量正电荷，在电泳时移向负极，刚好与移向正极的DNA结合，可以增加X光下的荧光强度。

再有，电泳和琼脂糖的质量关系很大，我在国内做实验的时候有幸体会过国产的琼脂糖有多垃圾，所以......换点儿好的琼脂糖用。祝你成功，如果还有问题，我可以给你上我的实验照片...

Answer 2

专业建议：低于200bp的片断，最好用3％或以上的胶检测。50bp的片断在3％的胶上，会跑在指示剂的后面，但很接近指示剂，所以电泳不要跑太快了，电压最好不要超过50V。另外，短片断电泳，要加大点样量，2ul太少了。

Answer 3

没有跑过这么短的片断 它要跑在指示剂的前面的了 小心跑出胶去了哦。我估计你跑电泳的时间太长了。通常2-300bp 我们跑30min-60mins

可能的话 改用PAGE，引物合成报告单上 都用PAGE的。