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一般与黑衣组织有关的剧情，灰原都有登场。
主线剧情=跟组织有关的：
001 云霄飞车杀人事件
054 电玩公司杀人事件
118 浪花连续杀人事件
128 黑衣组织10亿元抢劫事件
129 来自黑衣组织的女子 大学教授杀人事件★
130 竞技场无差别胁迫事件(前篇）
131 竞技场无差别胁迫事件(后篇）
170 黑暗中的死角（前篇）
171 黑暗中的死角（后篇）
176 与黑衣组织的再会（灰原篇）
177 与黑衣组织的再会（柯南篇）
178 与黑衣组织的再会（解决篇）
222 人鱼失踪记（事件篇）
223 人鱼失踪记（推理篇）
224 人鱼失踪记（解决篇）
226 格斗游戏的陷阱（前篇）
227 格斗游戏的陷阱（后篇）
230 谜一样的乘客（前篇）
231 谜一样的乘客（后篇）
242 元太的灾难
253 本厅的刑警恋爱物语4（前篇）
254 本厅的刑警恋爱物语4（后篇）
258 来自芝加哥的男人（前篇）
259 来自芝加哥的男人（后篇）
269 犯罪的纪念品（前篇）
270 犯罪的纪念品（后篇）
271 急忙掩饰的忽略（前篇）
272 急忙掩饰的忽略（后篇）
274 幽灵屋的真相（前篇）
275 幽灵屋的真相（后篇）
277 英语教师vs西部名侦探(前篇)
278 英语教师vs西部名侦探(后篇)
279 迷宫的阴暗（前篇）
280 迷宫的阴暗（后篇）
284 中华街 雨中的似曾相识(前篇）
285 中华街 雨中的似曾相识(后篇）
286 工藤新一NY事件（事件篇）
287 工藤新一NY事件（推理篇）
288 工藤新一NY事件（解决篇）
289 迷茫森林中的光彦（前篇）
290 迷途森林中的光彦（后篇）
305 看不见的嫌疑犯（前篇）
306 看不见的嫌疑犯（后篇）
307 无声的证词（前篇）
308 无声的证词（后篇）
309 与黑衣组织的接触（交涉篇）
310 与黑衣组织的接触（追踪篇）
311 与黑衣组织的接触（决死篇）
312 夕阳染红的女儿节人偶（前篇）
313 夕阳染红的女儿节人偶（后篇）
329 金钱买不到的友情（前篇）
330 金钱买不到的友情（后篇）
333 相似的公主（前篇）
334 相似的公主（后篇）
335 东都冲印所的秘密（前篇）
336 东都冲印所的秘密（后篇）
338 4辆保时捷（前篇）
339 4辆保时捷（后篇）
340 洗手间里隐藏的秘密（前篇）
341 洗手间里隐藏的秘密（后篇）
343 便利店的陷阱（前篇）
344 便利店的陷阱（后篇）
345 与黑衣组织正面对决 满月之夜的二元推理★
346 寻找屁股上的印记！（前篇）
347 寻找屁股上的印记！（后篇）
350 被遗忘的手机（前篇）
351 被遗忘的手机（后篇）
361 帝丹高中学校怪谈(前篇)
362 帝丹高中学校怪谈(后篇)
371 沉默的航线（前编）
372 沉默的航线（后编）
374 星星与香烟的暗号（前篇）
375 星星与香烟的暗号（后篇）
385 斯特拉迪瓦里小提琴的不和谐音(上)
386 斯特拉迪瓦里小提琴的不和谐音(中)
387 斯特拉迪瓦里小提琴的不和谐音(下)
394 奇异屋宇的大冒险（封印篇）
395 奇异屋宇的大冒险（机关篇）
396 奇异屋宇的大冒险（解决篇）
425 黑暗冲击！ 被组织的魔爪触碰的瞬间★
427 超秘密的上学路（前篇）
428 超秘密的上学路（后篇）
429 无法回到从前的两个人(前篇）
430 无法回到从前的两个人(后篇）
446 被封印的欧式窗（前篇）
447 被封印的欧式窗（后篇）
462 黑衣组织的影子 年幼的目击者
463 黑衣组织的影子 奇妙的照明
464 黑衣组织的影子 谜样的高额报酬
465 黑衣组织的影子 珍珠的流星
466 坚不可摧的雪人（前篇）
467 坚不可摧的雪人（后篇）
479 和服部平次在一起的3天★
484 黑色照片的行踪（前篇）
485 黑色照片的行踪（后篇）
491 红与黑的碰撞 开端
492 红与黑的碰撞 血缘
493 红与黑的碰撞 疾呼
494 红与黑的碰撞 冥土
495 红与黑的碰撞 昏睡
496 红与黑的碰撞 侵入
497 红与黑的碰撞 觉醒
498 红与黑的碰撞 扰乱
499 红与黑的碰撞 伪装
500 红与黑的碰撞 遗言
501 红与黑的碰撞 嫌疑
502 红与黑的碰撞 洁白
503 红与黑的碰撞 决死
504 红与黑的碰撞 殉职
接下来只有冲失昂出场跟主线有关 他是黑衣组织新出动的成员波本
也有人说他就是赤井秀一的
509 红黄白色与侦探团
510 柯南vs双重暗号之谜
511 推理对决！新一VS冲矢昴
525 令人憎恨的蓝色火花（后篇）
这是他出场的集数
漫画里演的更多一些
名侦探柯南第640话 营救
名侦探柯南第639话 讯息
名侦探柯南第638话 纸飞机
名侦探柯南第664话 一角岩
名侦探柯南第665话 鱼
名侦探柯南第666话 杀气
名侦探柯南第691话 柯南vs侦探团
而且漫画里赤井秀一已经登场了 而且还和朱蒂谈过恋爱呢
组织构成重要成员：
"那位先生"
姓名：不详
简述："那位先生"即组织内成员对黑组织首领的称呼。黑组织首领的身份一直是一个谜，即使在漫画中也从未露面或者有过一个剪影。现在唯一可以知道的是，组织的首领手机号码在鸟取县(TV387 斯特拉迪瓦里小提琴的不和谐音(尾奏曲))。据说作者青山刚昌曾经在2006年的一次访谈中指出组织的首领其实是之前的漫画中出现的人物，由此产生了一些猜测。
代号:琴酒 (GIN)
姓名:不详
性别：男
年龄：不详
简述：琴酒是组织中最早出现的人物，Vodka的大哥，新一就是被他从背后打倒，再灌下了毒药APTX4869。永远都是一身黑色长风衣，黑色的帽沿下披散的金色长发，和一张总是那样邪恶的脸。残酷无情，极度冷静,有着冷酷的眼神，杀过许多人也不在乎的样子,在组织里似乎有极高的地位，只要达到他的地位就可以见到"那位先生"，主要负责很危险的暗杀和重要交易。和雪莉似有很深的关系，是个智能型的罪犯，和柯南多次交手都未曾吃亏。有一辆从德国买来的黑色保时捷，型号是356A,左撇子。
声优：堀之纪
初登场：漫画：Vol.1 File.1 《平成的福尔摩斯》TV：001 云霄飞车杀人事件
代号：伏特加(Vodka)
姓名：不详
性别：男
年龄：不详
简述：琴酒的助手，也是早期登场的人物。Vodka长的非常壮，头脑简单，遇事没有主见，做事稍嫌不细密，全听琴酒的，称琴酒为「大哥」。有几次几乎上了柯南的当而暴露组织的情况，幸由琴酒发现而得以弥补。
声优：立木文彦
初登场：漫画：Vol.1 File.1 《平成的福尔摩斯》TV：001云霄飞车杀人事件
代号：苦艾酒（Vermouth 也有译为贝尔摩德）
姓名：克莉丝·温亚德
年龄：29岁
职业：演员
擅长：易容、射击
名言：A secret makes a woman woman
简述：组织重要人物之一，长得相当漂亮，头脑冷静，判断力强，是组织中相当有实力的人。公开身份是美国著名女演员。习惯于单独行动。深受组织"那位先生"的宠爱。曾化装成自己的母亲莎朗以及小兰学校的新出医生，时而复出，时而隐退，行迹与想法都无法掌握猜度，精通易容术，真实身份应该是其母亲莎朗.宾亚，纽约事件中变装成银发杀人犯 。把赤井秀一的存在视为银色子弹的危险。头脑好、枪法高明。在组织中负责收集重要的情报、她还是组织BOSS所中意的人。变装成新出老师、刺探出宫野志保（灰原哀），然后除之。好像非常痛恨宫野志保的双亲所研究的东西。可能也吃过APTX4869。二十年前杀死FBI探员朱蒂的父母，留下了一个带有指纹的眼镜，并因此而暴露身份。曾经帮过黑暗组织的一名成员皮斯科一回，一直在追查组织的叛徒雪莉，身手、智慧都堪与和琴酒媲美，大概还在其上。种种诡异的举动总是能让人感到不寒而栗，但是对柯南和小兰又极力的保护，似乎有叛变组织的倾向。
声优：小山茉美
初登场：漫画：Vol.24 File.8 《漆黑的葬丧行列》TV：176—178与黑暗组织的再会
代号：龙舌兰(Tequila，死亡)
姓名：不详
简述：组织人物之一，关西口音的大汉，在一次在和满天堂公司职员交易的时候因拿错箱子被误炸而死。曾与电脑工程师板仓卓接触过。
初登场：漫画：Vol.12 File.4 《突如其来的遭遇》TV：054 电玩公司杀人事件
代号：皮斯克(Pisco，死亡)
姓名：枡山宪三（升山绘三）
年龄：71岁
职业：汽车公司董事长
简述：组织人物之一，原名枡山宪三，身为汽车公司老板的他是经济界的巨子,同时也是为组织长年工作的老成员。他是宫野志保的父亲宫野厚司的好友，所以经常能听到一些开发中的药物的事情。与组织老大关系密切，封住有受贿嫌疑问题的政治家吞口重彦口的人。暗杀宫野志保失败。之后在漫画《背叛的街角》中，哀悼会上举枪射杀目标人物--另一组织成员吞口重彦时被在场记者拍到。因过多的失败，被琴酒所杀。
初登场：漫画：Vol.24 File.8 《漆黑的葬丧行列》TV：176—178与黑暗组织的再会
代号：卡尔瓦多斯(Calvados)
姓名：不详
简述：组织人物之一，似乎是苦艾酒的助手，是个枪法很准的狙击手。所持来福枪、手枪、猎枪等各种武器。最喜欢用的是猎枪。头次出场带着3把枪，之后就被赤井秀一打断双腿然后在自己被捕前自杀了。真是个倒霉的家伙，连个面都没露，连句话都没说出来……不过在2006年的SP TV425 黑色冲击！组织墨爪伸来的瞬间 中，在组织成员chianti和korn的回忆中出现过一个剪影，大约是一个戴眼镜的瘦高个子。但被赤井秀一所击中
初登场：漫画：File.433 《面具下的真相》TV：345 直面黑色组织的对决!满月之夜的二元神秘事件
代号：雪莉(Sherry)
姓名：宫野志保
化名：灰原哀
年龄：18
简述：组织科学家宫野厚司的次女。美国留学后在组织里负责开发APTX4869，是组织里的"红人"（琴酒语）。但在组织杀害她的姐姐宫野明美后放弃研制作为抗议。在被组织处决前服下APTX4869自杀，却变回小孩并逃出组织。现在化名灰原哀住在阿笠博士家中，和柯南一起生活并躲避组织的追杀。曾经在一次哀悼会中被皮斯克认出，并在短暂变回宫野志保后被琴酒枪击。多亏得到柯南的帮助才得以逃出。 后来在动画345中身份暴露，被Vermouth发现。但是至今为止不为Gin等其他成员所知。
初登场：TV 129 来自黑暗组织的女子
声优：林原惠美
代号：基安蒂(Chianti)
姓名：不详
简述：组织的优秀狙击手，据说有狙击600码外目标的能力。因为苦艾酒的行动害死了卡尔瓦多斯，对她非常反感。
初登场：TV 425 黑色的冲击！组织魔爪伸来的瞬间
声优： 井上喜久子
代号：科恩(Korn)
姓名：不详
简述：组织的优秀狙击手，和基安蒂是搭档，射击能力也与她不相上下。似乎和之前死去的卡尔瓦多斯关系很好。同样反感苦艾酒
初登场：TV 425 黑色的冲击！组织魔爪伸来的瞬间
声优：木下浩之
代号：波本(Bourbon)
姓名：不详
简述：谜一样的组织成员，对他的认识只少可以说仅次于那位先生。最早的“登场”来自于水无怜奈在返回组织后给FBI的一通电话中。水无怜奈提到组织为寻找雪莉而派出了强大的侦探。这名侦探很可能是组织高层人物，但是连水无怜奈也没有听说过，而他的代号就是波本（Bourbon ，一种烈性美国威士忌）。在随后的漫画中，可以感受到波本已经出现在柯南的周围。但并没有被明确地指出。有人认为赤井秀一死后忽然出现的大学生冲矢昴就是波本，但他也可能是赤井秀一假扮的。因此，这个人物虽然应该已经出现过了，但他究竟是谁还是一个谜。
初登场：存有疑问，动画尚未出。
代号：基尔(KIR)
姓名：本堂瑛海
化名：水无怜奈
简述：CIA特工，为破坏组织而打入内部。她的父亲伊森.本堂也是侦办组织的CIA特工，在女儿身份暴露后自杀，并伪造成审问基尔却反被她所杀的假象，使本堂瑛海躲过了组织的怀疑并得到"那位先生"的信任。她平时的身份是日卖电视台的主持人。在一次暗杀政要的行动中因为事故被FBI当作组织成员擒获，并一直在医院伪装昏迷。直到她"苏醒"后FBI才知道她的真实身份，并且将她送回组织继续完成任务。但在刚回去不久时，在琴酒的要求下杀死了赤井秀一。不过很多人怀疑这只是做给琴酒的戏而已。
初登场：TV 425 黑色的冲击！组织魔爪伸来的瞬间
声优：三石琴乃
代号：黑麦威士忌（RYE）
姓名：赤井秀一（あかい しゅういち akai shuichi)
化名：诸星大
年龄：不详。推测大约为28—30
爱车:雪弗莱C1500（黑色皮卡）
简述：神秘的FBI特工，以青山刚昌偶像红色彗星“夏亚”为原型创作的人物，宫野明美的男友，为进入组织曾接近明美，不过假戏真做陷入情网，后无奈与其分手，似与明美的妹妹志保有很深的关系。在组织待过三年，逐渐崭露头角成为重要骨干成员，又因FBI安德鲁·卡迈尔的失误被迫逃离组织，之后回到纽约，追击VERMOUTH，与黑组织的几次交手都呈现较大的优势，多次从枪口下就出灰原、柯南、毛利、JUDIE、JAMES等人，组织BOSS及GIN认为他是可以射穿黑组织心脏的银色子弹(SILVER BULLET)，是一个头脑一级，身手一级，枪法一级的人。平时总戴黑色针织帽，（492集受伤时没有戴），和GIN同为左撇子。在漫画单行本57—58与组织会击，为保护水无怜奈的卧底身份不被泄漏壮烈牺牲。不过大多数人认为这不过是个幌子，是青山掩人耳目的一招。File.622初登场的大学生冲矢昴，因为一些原因被认为可能是赤井秀一假扮的。
声优：池田秀一
初登场:TV230 充满谜团的乘客(前编)
姓名：宫野明美（死亡）
化名：广田雅美
年龄：24-25
简述：宫野志保的姐姐，黑暗组织的基层成员，赤井秀一的女朋友。参与了黑暗组织10亿元抢劫案，得手后因背叛组织被琴酒所杀。和妹妹志保不同，因为是基层成员，所以可以像正常人一样生活，但其实是在组织的监控下。是为了让志保脱离组织，作为交换条件，才加入组织的。为了逃避组织的追查，自己有一间秘密住所，为了自己和妹妹能够脱离组织，参与了抢劫10亿元的案件，最后被Gin杀死。
初登场：漫画Vol.2 File.6 《追踪高大的男人》TV：128 黑暗组织10亿抢劫事件
声优：玉川纱己子（赤井秀一配音池田秀一的妻子）
姓名：宫野 厚司（死亡）
简述：宫野志保的父亲，科学家。在科学界以"被业界驱逐的疯狂科学家"而知名。在发表会类的活动中遇到过阿笠博士，并表示过对阿笠博士的发明的兴趣，是个相当直爽的人。在组织中与妻子一起进行"使死者复活的秘密药物"的研究，在实验中因事故死亡（根据组织的报告）。在《夕阳染红的女儿节人偶》中被小哀提到。
姓名：宫野 艾理娜（死亡）
简述：宫野志保的母亲，可能是英国人。从英国到日本留学时遇到厚司，此后结婚。虽然跟阿立博士见过面，但因为其寡言少语，所以留下了不知道在想些什么的印象。虽然在组织中被称为地狱的坠落天使（HELL ANGEL）、但把录有自己声音的录音带委托给宫野明美交给女儿志保。录音带里反映出其对女儿志保的事情非常重视的想法。 性格忧郁阴沉，小哀的阴沉是她的遗传？与丈夫一同死亡。还有很多未可知之处，但是从留给女儿的录音带中可以了解到她其实很关心小哀。 在《金钱买不到的友情》中被博士提到。
- 原 佳明 - 日本 游戏工程师。因为入侵黑衣组织电脑被GIN所杀害。
初登场第五部剧场版——通往天国的倒数计时。
姓名：邵渊己一郎（死亡）
简述：组织底层人物之一，组织的一员，是末端的末端的人物。组织教他一系列的杀人手法，以协助优秀的杀手作案。但是他达不到预期的培养效用， 就被送到宫野志保处来作实验对象。后来在作人体实验前逃跑。后被警察逮捕判了死刑。
初登场：漫画：Vol.19 File.7 《钱包疑云》TV：118 浪花连续杀人事件
就目前来说组织里Gin最厉害了
主线剧情=跟组织有关的：
001 云霄飞车杀人事件
054 电玩公司杀人事件
118 浪花连续杀人事件
128 黑衣组织10亿元抢劫事件
129 来自黑衣组织的女子 大学教授杀人事件★
130 竞技场无差别胁迫事件(前篇）
131 竞技场无差别胁迫事件(后篇）
170 黑暗中的死角（前篇）
171 黑暗中的死角（后篇）
176 与黑衣组织的再会（灰原篇）
177 与黑衣组织的再会（柯南篇）
178 与黑衣组织的再会（解决篇）
222 人鱼失踪记（事件篇）
223 人鱼失踪记（推理篇）
224 人鱼失踪记（解决篇）
226 格斗游戏的陷阱（前篇）
227 格斗游戏的陷阱（后篇）
230 谜一样的乘客（前篇）
231 谜一样的乘客（后篇）
242 元太的灾难
253 本厅的刑警恋爱物语4（前篇）
254 本厅的刑警恋爱物语4（后篇）
258 来自芝加哥的男人（前篇）
259 来自芝加哥的男人（后篇）
269 犯罪的纪念品（前篇）
270 犯罪的纪念品（后篇）
271 急忙掩饰的忽略（前篇）
272 急忙掩饰的忽略（后篇）
274 幽灵屋的真相（前篇）
275 幽灵屋的真相（后篇）
277 英语教师vs西部名侦探(前篇)
278 英语教师vs西部名侦探(后篇)
279 迷宫的阴暗（前篇）
280 迷宫的阴暗（后篇）
284 中华街 雨中的似曾相识(前篇）
285 中华街 雨中的似曾相识(后篇）
286 工藤新一NY事件（事件篇）
287 工藤新一NY事件（推理篇）
288 工藤新一NY事件（解决篇）
289 迷茫森林中的光彦（前篇）
290 迷途森林中的光彦（后篇）
305 看不见的嫌疑犯（前篇）
306 看不见的嫌疑犯（后篇）
307 无声的证词（前篇）
308 无声的证词（后篇）
309 与黑衣组织的接触（交涉篇）
310 与黑衣组织的接触（追踪篇）
311 与黑衣组织的接触（决死篇）
312 夕阳染红的女儿节人偶（前篇）
313 夕阳染红的女儿节人偶（后篇）
329 金钱买不到的友情（前篇）
330 金钱买不到的友情（后篇）
333 相似的公主（前篇）
334 相似的公主（后篇）
335 东都冲印所的秘密（前篇）
336 东都冲印所的秘密（后篇）
338 4辆保时捷（前篇）
339 4辆保时捷（后篇）
340 洗手间里隐藏的秘密（前篇）
341 洗手间里隐藏的秘密（后篇）
343 便利店的陷阱（前篇）
344 便利店的陷阱（后篇）
345 与黑衣组织正面对决 满月之夜的二元推理★
346 寻找屁股上的印记！（前篇）
347 寻找屁股上的印记！（后篇）
350 被遗忘的手机（前篇）
351 被遗忘的手机（后篇）
361 帝丹高中学校怪谈(前篇)
362 帝丹高中学校怪谈(后篇)
371 沉默的航线（前编）
372 沉默的航线（后编）
374 星星与香烟的暗号（前篇）
375 星星与香烟的暗号（后篇）
385 斯特拉迪瓦里小提琴的不和谐音(上)
386 斯特拉迪瓦里小提琴的不和谐音(中)
387 斯特拉迪瓦里小提琴的不和谐音(下)
394 奇异屋宇的大冒险（封印篇）
395 奇异屋宇的大冒险（机关篇）
396 奇异屋宇的大冒险（解决篇）
425 黑暗冲击！ 被组织的魔爪触碰的瞬间★
427 超秘密的上学路（前篇）
428 超秘密的上学路（后篇）
429 无法回到从前的两个人(前篇）
430 无法回到从前的两个人(后篇）
446 被封印的欧式窗（前篇）
447 被封印的欧式窗（后篇）
462 黑衣组织的影子 年幼的目击者
463 黑衣组织的影子 奇妙的照明
464 黑衣组织的影子 谜样的高额报酬
465 黑衣组织的影子 珍珠的流星
466 坚不可摧的雪人（前篇）
467 坚不可摧的雪人（后篇）
479 和服部平次在一起的3天★
484 黑色照片的行踪（前篇）
485 黑色照片的行踪（后篇）
491 红与黑的碰撞 开端
492 红与黑的碰撞 血缘
493 红与黑的碰撞 疾呼
494 红与黑的碰撞 冥土
495 红与黑的碰撞 昏睡
496 红与黑的碰撞 侵入
497 红与黑的碰撞 觉醒
498 红与黑的碰撞 扰乱
499 红与黑的碰撞 伪装
500 红与黑的碰撞 遗言
501 红与黑的碰撞 嫌疑
502 红与黑的碰撞 洁白
503 红与黑的碰撞 决死
504 红与黑的碰撞 殉职
接下来只有冲失昂出场跟主线有关 他是黑衣组织新出动的成员波本
也有人说他就是赤井秀一的
509 红黄白色与侦探团
510 柯南vs双重暗号之谜
511 推理对决！新一VS冲矢昴
525 令人憎恨的蓝色火花（后篇）
这是他出场的集数
漫画里演的更多一些
名侦探柯南第640话 营救
名侦探柯南第639话 讯息
名侦探柯南第638话 纸飞机
名侦探柯南第664话 一角岩
名侦探柯南第665话 鱼
名侦探柯南第666话 杀气
名侦探柯南第691话 柯南vs侦探团
而且漫画里赤井秀一已经登场了 而且还和朱蒂谈过恋爱呢
组织构成重要成员：
"那位先生"
姓名：不详
简述："那位先生"即组织内成员对黑组织首领的称呼。黑组织首领的身份一直是一个谜，即使在漫画中也从未露面或者有过一个剪影。现在唯一可以知道的是，组织的首领手机号码在鸟取县(TV387 斯特拉迪瓦里小提琴的不和谐音(尾奏曲))。据说作者青山刚昌曾经在2006年的一次访谈中指出组织的首领其实是之前的漫画中出现的人物，由此产生了一些猜测。
代号:琴酒 (GIN)
姓名:不详
性别：男
年龄：不详
简述：琴酒是组织中最早出现的人物，Vodka的大哥，新一就是被他从背后打倒，再灌下了毒药APTX4869。永远都是一身黑色长风衣，黑色的帽沿下披散的金色长发，和一张总是那样邪恶的脸。残酷无情，极度冷静,有着冷酷的眼神，杀过许多人也不在乎的样子,在组织里似乎有极高的地位，只要达到他的地位就可以见到"那位先生"，主要负责很危险的暗杀和重要交易。和雪莉似有很深的关系，是个智能型的罪犯，和柯南多次交手都未曾吃亏。有一辆从德国买来的黑色保时捷，型号是356A,左撇子。
声优：堀之纪
初登场：漫画：Vol.1 File.1 《平成的福尔摩斯》TV：001 云霄飞车杀人事件
代号：伏特加(Vodka)
姓名：不详
性别：男
年龄：不详
简述：琴酒的助手，也是早期登场的人物。Vodka长的非常壮，头脑简单，遇事没有主见，做事稍嫌不细密，全听琴酒的，称琴酒为「大哥」。有几次几乎上了柯南的当而暴露组织的情况，幸由琴酒发现而得以弥补。
声优：立木文彦
初登场：漫画：Vol.1 File.1 《平成的福尔摩斯》TV：001云霄飞车杀人事件
代号：苦艾酒（Vermouth 也有译为贝尔摩德）
姓名：克莉丝·温亚德
年龄：29岁
职业：演员
擅长：易容、射击
名言：A secret makes a woman woman
简述：组织重要人物之一，长得相当漂亮，头脑冷静，判断力强，是组织中相当有实力的人。公开身份是美国著名女演员。习惯于单独行动。深受组织"那位先生"的宠爱。曾化装成自己的母亲莎朗以及小兰学校的新出医生，时而复出，时而隐退，行迹与想法都无法掌握猜度，精通易容术，真实身份应该是其母亲莎朗.宾亚，纽约事件中变装成银发杀人犯 。把赤井秀一的存在视为银色子弹的危险。头脑好、枪法高明。在组织中负责收集重要的情报、她还是组织BOSS所中意的人。变装成新出老师、刺探出宫野志保（灰原哀），然后除之。好像非常痛恨宫野志保的双亲所研究的东西。可能也吃过APTX4869。二十年前杀死FBI探员朱蒂的父母，留下了一个带有指纹的眼镜，并因此而暴露身份。曾经帮过黑暗组织的一名成员皮斯科一回，一直在追查组织的叛徒雪莉，身手、智慧都堪与和琴酒媲美，大概还在其上。种种诡异的举动总是能让人感到不寒而栗，但是对柯南和小兰又极力的保护，似乎有叛变组织的倾向。
声优：小山茉美
初登场：漫画：Vol.24 File.8 《漆黑的葬丧行列》TV：176—178与黑暗组织的再会
代号：龙舌兰(Tequila，死亡)
姓名：不详
简述：组织人物之一，关西口音的大汉，在一次在和满天堂公司职员交易的时候因拿错箱子被误炸而死。曾与电脑工程师板仓卓接触过。
初登场：漫画：Vol.12 File.4 《突如其来的遭遇》TV：054 电玩公司杀人事件
代号：皮斯克(Pisco，死亡)
姓名：枡山宪三（升山绘三）
年龄：71岁
职业：汽车公司董事长
简述：组织人物之一，原名枡山宪三，身为汽车公司老板的他是经济界的巨子,同时也是为组织长年工作的老成员。他是宫野志保的父亲宫野厚司的好友，所以经常能听到一些开发中的药物的事情。与组织老大关系密切，封住有受贿嫌疑问题的政治家吞口重彦口的人。暗杀宫野志保失败。之后在漫画《背叛的街角》中，哀悼会上举枪射杀目标人物--另一组织成员吞口重彦时被在场记者拍到。因过多的失败，被琴酒所杀。
初登场：漫画：Vol.24 File.8 《漆黑的葬丧行列》TV：176—178与黑暗组织的再会
代号：卡尔瓦多斯(Calvados)
姓名：不详
简述：组织人物之一，似乎是苦艾酒的助手，是个枪法很准的狙击手。所持来福枪、手枪、猎枪等各种武器。最喜欢用的是猎枪。头次出场带着3把枪，之后就被赤井秀一打断双腿然后在自己被捕前自杀了。真是个倒霉的家伙，连个面都没露，连句话都没说出来……不过在2006年的SP TV425 黑色冲击！组织墨爪伸来的瞬间 中，在组织成员chianti和korn的回忆中出现过一个剪影，大约是一个戴眼镜的瘦高个子。但被赤井秀一所击中
初登场：漫画：File.433 《面具下的真相》TV：345 直面黑色组织的对决!满月之夜的二元神秘事件
代号：雪莉(Sherry)
姓名：宫野志保
化名：灰原哀
年龄：18
简述：组织科学家宫野厚司的次女。美国留学后在组织里负责开发APTX4869，是组织里的"红人"（琴酒语）。但在组织杀害她的姐姐宫野明美后放弃研制作为抗议。在被组织处决前服下APTX4869自杀，却变回小孩并逃出组织。现在化名灰原哀住在阿笠博士家中，和柯南一起生活并躲避组织的追杀。曾经在一次哀悼会中被皮斯克认出，并在短暂变回宫野志保后被琴酒枪击。多亏得到柯南的帮助才得以逃出。 后来在动画345中身份暴露，被Vermouth发现。但是至今为止不为Gin等其他成员所知。
初登场：TV 129 来自黑暗组织的女子
声优：林原惠美
代号：基安蒂(Chianti)
姓名：不详
简述：组织的优秀狙击手，据说有狙击600码外目标的能力。因为苦艾酒的行动害死了卡尔瓦多斯，对她非常反感。
初登场：TV 425 黑色的冲击！组织魔爪伸来的瞬间
声优： 井上喜久子
代号：科恩(Korn)
姓名：不详
简述：组织的优秀狙击手，和基安蒂是搭档，射击能力也与她不相上下。似乎和之前死去的卡尔瓦多斯关系很好。同样反感苦艾酒
初登场：TV 425 黑色的冲击！组织魔爪伸来的瞬间
声优：木下浩之
代号：波本(Bourbon)
姓名：不详
简述：谜一样的组织成员，对他的认识只少可以说仅次于那位先生。最早的“登场”来自于水无怜奈在返回组织后给FBI的一通电话中。水无怜奈提到组织为寻找雪莉而派出了强大的侦探。这名侦探很可能是组织高层人物，但是连水无怜奈也没有听说过，而他的代号就是波本（Bourbon ，一种烈性美国威士忌）。在随后的漫画中，可以感受到波本已经出现在柯南的周围。但并没有被明确地指出。有人认为赤井秀一死后忽然出现的大学生冲矢昴就是波本，但他也可能是赤井秀一假扮的。因此，这个人物虽然应该已经出现过了，但他究竟是谁还是一个谜。
初登场：存有疑问，动画尚未出。
代号：基尔(KIR)
姓名：本堂瑛海
化名：水无怜奈
简述：CIA特工，为破坏组织而打入内部。她的父亲伊森.本堂也是侦办组织的CIA特工，在女儿身份暴露后自杀，并伪造成审问基尔却反被她所杀的假象，使本堂瑛海躲过了组织的怀疑并得到"那位先生"的信任。她平时的身份是日卖电视台的主持人。在一次暗杀政要的行动中因为事故被FBI当作组织成员擒获，并一直在医院伪装昏迷。直到她"苏醒"后FBI才知道她的真实身份，并且将她送回组织继续完成任务。但在刚回去不久时，在琴酒的要求下杀死了赤井秀一。不过很多人怀疑这只是做给琴酒的戏而已。
初登场：TV 425 黑色的冲击！组织魔爪伸来的瞬间
声优：三石琴乃
代号：黑麦威士忌（RYE）
姓名：赤井秀一（あかい しゅういち akai shuichi)
化名：诸星大
年龄：不详。推测大约为28—30
爱车:雪弗莱C1500（黑色皮卡）
简述：神秘的FBI特工，以青山刚昌偶像红色彗星“夏亚”为原型创作的人物，宫野明美的男友，为进入组织曾接近明美，不过假戏真做陷入情网，后无奈与其分手，似与明美的妹妹志保有很深的关系。在组织待过三年，逐渐崭露头角成为重要骨干成员，又因FBI安德鲁·卡迈尔的失误被迫逃离组织，之后回到纽约，追击VERMOUTH，与黑组织的几次交手都呈现较大的优势，多次从枪口下就出灰原、柯南、毛利、JUDIE、JAMES等人，组织BOSS及GIN认为他是可以射穿黑组织心脏的银色子弹(SILVER BULLET)，是一个头脑一级，身手一级，枪法一级的人。平时总戴黑色针织帽，（492集受伤时没有戴），和GIN同为左撇子。在漫画单行本57—58与组织会击，为保护水无怜奈的卧底身份不被泄漏壮烈牺牲。不过大多数人认为这不过是个幌子，是青山掩人耳目的一招。File.622初登场的大学生冲矢昴，因为一些原因被认为可能是赤井秀一假扮的。
声优：池田秀一
初登场:TV230 充满谜团的乘客(前编)
姓名：宫野明美（死亡）
化名：广田雅美
年龄：24-25
简述：宫野志保的姐姐，黑暗组织的基层成员，赤井秀一的女朋友。参与了黑暗组织10亿元抢劫案，得手后因背叛组织被琴酒所杀。和妹妹志保不同，因为是基层成员，所以可以像正常人一样生活，但其实是在组织的监控下。是为了让志保脱离组织，作为交换条件，才加入组织的。为了逃避组织的追查，自己有一间秘密住所，为了自己和妹妹能够脱离组织，参与了抢劫10亿元的案件，最后被Gin杀死。
初登场：漫画Vol.2 File.6 《追踪高大的男人》TV：128 黑暗组织10亿抢劫事件
声优：玉川纱己子（赤井秀一配音池田秀一的妻子）
姓名：宫野 厚司（死亡）
简述：宫野志保的父亲，科学家。在科学界以"被业界驱逐的疯狂科学家"而知名。在发表会类的活动中遇到过阿笠博士，并表示过对阿笠博士的发明的兴趣，是个相当直爽的人。在组织中与妻子一起进行"使死者复活的秘密药物"的研究，在实验中因事故死亡（根据组织的报告）。在《夕阳染红的女儿节人偶》中被小哀提到。
姓名：宫野 艾理娜（死亡）
简述：宫野志保的母亲，可能是英国人。从英国到日本留学时遇到厚司，此后结婚。虽然跟阿立博士见过面，但因为其寡言少语，所以留下了不知道在想些什么的印象。虽然在组织中被称为地狱的坠落天使（HELL ANGEL）、但把录有自己声音的录音带委托给宫野明美交给女儿志保。录音带里反映出其对女儿志保的事情非常重视的想法。 性格忧郁阴沉，小哀的阴沉是她的遗传？与丈夫一同死亡。还有很多未可知之处，但是从留给女儿的录音带中可以了解到她其实很关心小哀。 在《金钱买不到的友情》中被博士提到。
- 原 佳明 - 日本 游戏工程师。因为入侵黑衣组织电脑被GIN所杀害。
初登场第五部剧场版——通往天国的倒数计时。
姓名：邵渊己一郎（死亡）
简述：组织底层人物之一，组织的一员，是末端的末端的人物。组织教他一系列的杀人手法，以协助优秀的杀手作案。但是他达不到预期的培养效用， 就被送到宫野志保处来作实验对象。后来在作人体实验前逃跑。后被警察逮捕判了死刑。
初登场：漫画：Vol.19 File.7 《钱包疑云》TV：118 浪花连续杀人事件
就目前来说组织里Gin最厉害了
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您好！
001 云霄飞车杀人事件
013 奇妙的寻人杀人事件
054 电玩公司杀人事件
128 黑衣组织十亿元抢劫事件
129 来自黑暗组织的女子 大学教授杀人事件
176 与黑暗组织的再会（灰原篇）
177 与黑暗组织的再会（柯南篇）
178 与黑暗组织的再会（解决篇）
230 迷一样的乘客（前篇）
231 迷一样的乘客（后篇）
271 隐藏匆忙中的省略（前篇）
272 隐藏匆忙中的省略（后篇）
286 工藤新一纽约事件（事件篇）
287 工藤新一纽约事件（推理篇）
288 工藤新一纽约事件（解决篇）
307 没有声音的证词（前篇）
308 没有声音的证词（后篇）
309 与黑暗组织的接触（交涉篇）
310 与黑暗组织的接触（追迹篇）
311 与黑暗组织的接触（决死篇）
338 四台保时捷（前篇）
339 四台保时捷（后篇）
340 厕所隐藏的秘密（前篇）
341 厕所隐藏的秘密（后篇）
345 与黑暗组织的直面对决 满月之夜的二元推理
425 黑色的冲击！黑衣组织的魔爪伸来的瞬间
462 黑暗组织的影子 年幼的目击者
463 黑暗组织的影子 奇妙的照明
464 黑暗组织的影子 谜样的高额报酬
465 黑暗组织的影子 珍珠的流星
491 红与黑的碰撞 开端
492 红与黑的碰撞 血缘
493 红与黑的碰撞 疾呼
494 红与黑的碰撞 冥土
495 红与黑的碰撞 昏睡
496 红与黑的碰撞 侵入
497 红与黑的碰撞 觉醒
498 红与黑的碰撞 搅乱
499 红与黑的碰撞 伪装
500 红与黑的碰撞 遗言
501 红与黑的碰撞 嫌疑
502 红与黑的碰撞 洁白
503 红与黑的碰撞 决死
504 红与黑的碰撞 殉职
509 红白黄色与侦探团
510 柯南VS双重暗号之谜
511 推理对决！新一VS冲矢昴
542 鱼儿消失的一角岩（前篇）
543 鱼儿消失的一角岩（后篇）
563 侦探团VS劫匪团 骚动
564 侦探团VS劫匪团 沉默
578 召唤危机的红色前兆
579 黑色13的暗示
580 逼近的黑之时限
581 摇曳的红色目标
622 紧急事态252（前篇）
623 紧急事态252（后篇）
剧场版05：通往天国的倒计时
剧场版13：漆黑的追踪者
（如果您觉得满意，请不要忘记采纳，谢谢！）
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128 黑衣组织十亿元抢劫事件
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176 与黑暗组织的再会（灰原篇）
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230 迷一样的乘客（前篇）
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271 隐藏匆忙中的省略（前篇）
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286 工藤新一纽约事件（事件篇）
287 工藤新一纽约事件（推理篇）
288 工藤新一纽约事件（解决篇）
307 没有声音的证词（前篇）
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309 与黑暗组织的接触（交涉篇）
310 与黑暗组织的接触（追迹篇）
311 与黑暗组织的接触（决死篇）
338 四台保时捷（前篇）
339 四台保时捷（后篇）
340 厕所隐藏的秘密（前篇）
341 厕所隐藏的秘密（后篇）
345 与黑暗组织的直面对决 满月之夜的二元推理
425 黑色的冲击！黑衣组织的魔爪伸来的瞬间
462 黑暗组织的影子 年幼的目击者
463 黑暗组织的影子 奇妙的照明
464 黑暗组织的影子 谜样的高额报酬
465 黑暗组织的影子 珍珠的流星
491 红与黑的碰撞 开端
492 红与黑的碰撞 血缘
493 红与黑的碰撞 疾呼
494 红与黑的碰撞 冥土
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496 红与黑的碰撞 侵入
497 红与黑的碰撞 觉醒
498 红与黑的碰撞 搅乱
499 红与黑的碰撞 伪装
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501 红与黑的碰撞 嫌疑
502 红与黑的碰撞 洁白
503 红与黑的碰撞 决死
504 红与黑的碰撞 殉职
509 红白黄色与侦探团
510 柯南VS双重暗号之谜
511 推理对决！新一VS冲矢昴
542 鱼儿消失的一角岩（前篇）
543 鱼儿消失的一角岩（后篇）
563 侦探团VS劫匪团 骚动
564 侦探团VS劫匪团 沉默
578 召唤危机的红色前兆
579 黑色13的暗示
580 逼近的黑之时限
581 摇曳的红色目标
622 紧急事态252（前篇）
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剧场版05：通往天国的倒计时
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