Question

PCR扩增后没有条带是怎么回事

Answer 1

PCR的反应条件与很多参数有关系。如模板浓度，引物长度及GC含量，引物浓度，dNTPs浓度，选用的taq enzyme,缓冲液的离子含量，产物大小，变性时间，退火温度及时间，延长的时间。

物理原因：变性对PCR扩增来说相当重要，如变性温度低，变性时间短，极有可能出现假阴性;退火温度过低，可致非特异性扩增而降低特异性扩增效率退火温度过高影响引物与模板的结合而降低PCR扩增效率。

有时还有必要用标准的温度计，检测一下扩增仪或水溶锅内的变性、退火和延伸温度，这也是PCR失败的原因之一。

靶序列变异：如靶序列发生突变或缺失，影响引物与模板特异性结合，或因靶序列某 段缺失使引物与模板失去互补序列，其PCR扩增是不会成功的。

扩展资料：

该反应分三步进行：

a、DNA模板（目的基因和引物）高温度变性（95°C） 使之解链。

b、降温复性（40°C-60°C），使目的基因与引物杂交。

c、在70°C-75°C的温度下，DNA聚合酶进行酶促聚合反应，使目的基因DNA序列在3’位置上逐渐延伸。新合成的引物延伸链又可以作为下一步反应的模板，如此反复循环进行，按照2^n的指数扩增，短时间内可获得大量的DNA目的基因。

参考资料来源：百度百科-DNA的PCR扩增

Answer 2

SSR用4%PAGE胶检测,加样时一定要注意最后分开加的引物家进去了,而且够量(0.5ul是很少的,要注意).我用的PCR程序是94度10分钟,94度35秒.55度35秒,72度45秒,35循环,最后再10分钟的72度.
你测到的1.8只是说明DNA比较纯,也许模板浓度不够啊,要达到5ng/ul以上才好用,模板浓度太低也扩不出来的.
你跑胶之后有没有引物二聚体的带,如果有,说明模板加的正常,如果没有,可能是加模板没加好.
水只要用灭菌的纯水就行了,没什么的,师兄都说PCR是很粗放,很简单的.加油!!!

Answer 3

PCR反应的关键环节有①模板核酸的制备，②引物的质量与特异性，③酶的质量及， ④PCR循环条件。寻找原因亦应针对上述环节进行分析研究。
　　模板：①模板中含有杂蛋白质，②模板中含有Taq酶抑制剂，③模板中蛋白质没有消 化除净，特别是染色体中的组蛋白，④在提取制备模板时丢失过多，或吸入酚。⑤模 板核酸变性不彻底。在酶和引物质量好时，不出现扩增带，极有可能是标本的消化处 理，模板核酸提取过程出了毛病，因而要配制有效而稳定的消化处理液，其程序亦应 固定不宜随意更改。
　　酶失活：需更换新酶，或新旧两种酶同时使用，以分析是否因酶的活性丧失或不够而 导致假阴性。需注意的是有时忘加Taq酶或溴乙锭。
　　引物：引物质量、引物的浓度、两条引物的浓度是否对称，是PCR失败或扩增条带不 理想、容易弥散的常见原因。有些批号的引物合成质量有问题，两条引物一条浓度 高，一条浓度低，造成低效率的不对称扩增，对策为：①选定一个好的引物合成单 位。②引物的浓度不仅要看OD值，更要注重引物原液做琼脂糖凝胶电泳，一定要有引物条带出现，而且两引物带的亮度应大体一致，如一条引物有条带，一条引物无条带，此时做PCR有可能失败，应和引物合成单位协商解决。如一条引物亮度高，一条亮度低，在稀释引物时要平衡其浓度。③引物应高浓度小量分装保存，防止多次冻融或长期放冰箱冷藏部分，导致引物变质降解失效。④引物设计不合理，如引物长度不够，引物之间形成二聚体等。
　　Mg2+浓度：Mg2+离子浓度对PCR扩增效率影响很大，浓度过高可降低PCR扩增的特 异性，浓度过低则影响PCR扩增产量甚至使PCR扩增失败而不出扩增条带。
　　反应体积的改变：通常进行PCR扩增采用的体积为20ul、30ul、50ul。或100ul，应用多 大体积进行PCR扩增，是根据科研和临床检测不同目的而设定，在做小体积如20ul 后，再做大体积时，一定要模索条件，否则容易失败。
　　物理原因：变性对PCR扩增来说相当重要，如变性温度低，变性时间短，极有可能出现假阴性;退火温度过低，可致非特异性扩增而降低特异性扩增效率退火温度过高影响引物与模板的结合而降低PCR扩增效率。有时还有必要用标准的温度计，检测一下扩增仪或水溶锅内的变性、退火和延伸温度，这也是PCR失败的原因之一。
　　靶序列变异：如靶序列发生突变或缺失，影响引物与模板特异性结合，或因靶序列某 段缺失使引物与模板失去互补序列，其PCR扩增是不会成功的。