Question

您好，想咨询下细菌全基因组测序问题

我是一个研二基因小白，啥也不懂，老师要的紧。我们要测得这株菌基因组大概是1.8Mb GC含量差不多是30-40%，想做全基因组测序。实验室经费有限，问了华大、诺禾致源的三代测序要2万多，诺合的二代是1万，老师就让定在诺合用二代方法测序。我们学校要求是发SCI才能毕业，师兄说上海美吉二代是3500 三代是15,000。我不明白为啥价格相差这么多，就不知道该如何选择了。而且是说二代不能得到完成图 只能得到精细图吗

Answer 1

代谢通路是kegg数据库里的pathway数据库。
可以通过全基因组预测了编码基因后，进行pathway数据库注释，从注释结果的功能信息中通过关键字查找。
一般都能找到。
如果找不到，有可能是关键字不对或者基因组中没有这样的代谢通路功能基因。