Question

头一阵阵的痛。日语怎么说？

Answer 1

随意说的话是：头がズキズキ痛い！
比较标准的是：头がずきずきする。现在正在疼的话就是头がずきずきしている。

头はときどき痛いです是指头只是偶尔疼的意思。（ときどき表示频率很低，相当低）
另外不要乱用阵痛（じんつう），日语中阵痛是指分娩时“那个地方“收缩而产生的腹部间歇性疼痛，不是你的头！！......

Answer 2

头はときどき痛いです

Answer 3

头(あたま）が　阵痛（じんつう）してる。