第一种：底缸过滤系统
底滤是利用一个放置于底柜的大型滤槽（称为底缸），通过管道与主缸连接，利用水泵来完成水的循环，滤槽根据尺寸及实际需要分为若干格，用来分别放置不同的滤材或器材，底缸过滤一般采用溢流的下水方式，在形式上分为三角溢流、方形溢流、圆形溢流、三重溢流管溢流、不打孔溢流等多种形式。
进出水的两种结构方式：
有单侧进出水的结构，也有两侧进出水的结构，不管哪种解决的问题是一样的，如果使用底滤建议选择单侧进出水形式，鱼缸会更美观，不然鱼缸两边各一根管子。
单侧进、出水
两侧进、出水
结构原理：
大家在图中可以看到，下缸体就是底滤过滤系统，有足够大的空间放置各种滤材，左侧水泵将过滤好的水抽如鱼缸左侧通过溢流将水排到底滤鱼缸水体通过第一个过滤棉进行物理过滤再通过后面几格滤材进行生化过滤再流进上水格完成鱼缸水循环。
优点：物理生化过滤完美搭配、增大了整个系统的水体，更有利于保持水质的稳定。底缸空间较大可以放置更多的过滤材料。底缸有更多的空间可以放置各种器材，使主缸更整洁美观。换水等操作可以在底缸进行，有效减少对缸内生物造成的影响。
缺点：鱼缸水位不好调解、结构复杂，制作成本较高、出水口调节不好噪音大、水泵扬程变长功率也会相应增大，耗电量也会增加。
适用性：
比较适用1米以上的大型鱼缸，养一些大型鱼使用，小型鱼缸不合适使用，不值得这样折腾，但可以选用底滤。
不适合草缸使用，鱼缸里进出水结构不适合用于草缸。
第二种：背滤、侧滤过滤系统
背滤和侧滤是在鱼缸的背部或侧部用玻璃隔出一部分做过滤，其内部分成几小格用于放置滤材和循环泵，一边设有溢流口，当水泵把水从过滤部分抽向鱼缸时，鱼缸溢出的水通过溢流口流入过滤部分的第一格，在隔板的引导下流经各种滤材，水从最后一格通过水泵再次送入鱼缸形成循环。
优点：利用鱼缸的内部空间使鱼缸和过滤形成一个整体，不需另外利用其它缸外位置就可以完成较好的过滤流程。过滤效果可以满足使用。
缺点：占用了鱼缸的部分空间，缸内的空间会减少、受鱼缸宽度或长度的限制，影响美观。
