不是不想杀他而是迫于当时的形势，不能贸然出兵追他，一旦司马懿在后方设有伏兵，有可能就会把蜀国仅有的兵力给葬送掉，这是诸葛亮不想看到的一个局面，毕竟北伐已经进入到了一个白热化的状态，哪一方稍微犯一点点错，就会陷入万劫不复的地步。
不仅如此，诸葛亮可以说是一个谨小慎微的一个人，他不会去打这种没把握的仗，本来说上方谷的这场大火，可以有机会把司马懿给杀死，但是老天跟他开了一个玩笑，突然下了一场大雨，救了司马懿一条性命。所以在某种程度上面诸葛亮就会觉得这是上天给司马懿留了一条活路，毕竟祁山这个地方可是好几年都不下雨的。
除此之外，诸葛亮当时的身体状况已经支撑不了他再打下一场战争了。上方谷战役之后没过多久，诸葛亮就一命呜呼了。所以他要提前把这些后路给布置好，毕竟这么大的一支军队想要安然撤退，并不是一件非常容易的事情。
虽然表面上看司马懿狼狈败逃而去，但是其实他的兵力并没有受损太多，一旦他回过去缓过神来有可能会再次卷土重来，这个时候失去主心骨的蜀国，有可能就会抵挡不住司马懿的进攻，从而被魏国歼灭。
所以诸葛亮也是在他死后吩咐他的手下推着他的木雕像放在悬崖边上，来达到一个吓唬司马懿的效果，结果也是好的成功的把司马懿给吓退了，大军得以安然撤退。
其实并不见得诸葛亮有机会，诸葛亮在上方谷一场大雨之后，感慨道“谋事在人，成事在天，不可强也。”其中意思很明显，其实很多人认为即使是下雨，司马懿也不见得能逃脱，这主要还是诸葛亮心灰意冷，从这12个字就能看出诸葛亮已经心如死灰，不愿与天斗，完全一副听天由命的颓废状态。
刘备为替二弟关羽报仇，举国之力攻打东吴，惨败给东吴大将陆逊，败光了多年积攒下的家底，因承受不住打击，最终病逝于白帝城，诸葛亮明知不可为而为之，挥师北伐，不给曹魏集团喘息之机。前几次都败了，公元234年，诸葛亮六出祁山，绞尽脑汁才把司马懿引诱到上方谷。有种种说法是，诸葛亮虽懂得天文地理，却不了解上方谷下雨的原理。上方谷是一个绝好的打伏击地点，整个地形似葫芦转，只有一个狭窄的入口可以出去，中间低，四周高。诸葛亮将司马懿引入谷中，纵火燃烧。山谷中温度升高，空气随着火势冲出山谷到达山顶，而底部两边的空气接连不断的补充过来。这样高温的空气在上方谷上面遇到冷空气，凝结雨滴，致使大雨倾盆。
而一场大雨后，诸葛亮也曾说:祁山已经几个月不曾下雨，为何今日大雨倾盆。也就是说诸葛亮夜观天象，是没有雨的，突然来的大雨也就只能这么理解了，正是由于诸葛不了解山地下雨的原因，才没有杀掉司马懿。诸葛亮用计终于把司马懿困在上方谷，眼看司马懿马上就要葬身火海，心中好不欢喜。司马懿也心知自己怕是要死了，无奈悲凉接受这结局。可是天有不测风云，一切皆有命中定数。万里无云的晴空，突然乌云笼罩，片刻之间暴雨倾盆而下，把大火火熄灭。
诸葛亮叹道：天不助汉，徒呼奈何！诸葛亮以谨小慎微而著称，想不到还是让司马懿钻了空子，他认为是老天爷帮忙的结果。他不得不审视自己的行为，难道自己所作所为有违天命？天不灭曹？这时诸葛亮悠悠的说的一句，"不可强也"。换种说法就是，算了，既然老天放过司马懿，自己也就不强求了。
