宫野厚司、宫野艾莲娜夫妇进入黑衣组织，参与APTX4869的研究，后“意外死亡”，留下女儿宫野明美与宫野志保。志保到美国留学，后回日本继续研发APTX4869，代号雪莉。
组织杀手贝尔摩得杀害了一个一直在调查组织的FBI探员，并放火烧了他的家。探员年幼的女儿茱蒂·斯泰琳幸免于难，并被她父亲的同事保护起来，长大后加入FBI。茱蒂对贝尔摩德所说的"A secret makes a woman woman”一直印象深刻。
女明星莎朗·温亚德（即贝尔摩得）和工藤有希子一起向魔术师黑羽盗一学习易容术并成为好友。
307-308 龙舌兰找到板仓卓，命他开发一种系统软件，但遭拒。组织之后不断骚扰板仓卓，最终迫使他就犯。
286-288
毛利兰在纽约遇到追捕银发杀人魔的FBI搜查官赤井秀一，又在废仓库遇到逃亡中的受伤的银发杀人魔。杀人魔想将工藤新一和兰灭口，因栏杆断裂而从高处掉落，被二人所救。事后杀人魔被发现自杀，但是可疑的是现场所有的痕迹都被抹去。（被兰所救的杀人魔实为贝尔摩得假扮，“自杀”的杀人魔为贝尔摩得所杀）
- 莎朗假死，以女儿克丽丝的身份继续生活下去。
1、2、4
新一在与兰去游乐场玩时目睹了组织的地下交易，被琴酒、伏特加发现，强行灌药变小。新一将此事告知阿笠博士，后决定隐藏身份，化名江户川柯南，寄住在毛利小五郎家，转入帝丹小学。
5
漫画中柯南得知了琴酒和伏特加的代号，并阻止了新干线爆炸。（对应动画被修改为与组织无关）
43
工藤优作、有希子夫妇得知柯南身份。
48-49
柯南意外短暂恢复。服部平次开始怀疑柯南身份。
54
柯南偶遇龙舌兰，但龙舌兰随即被误杀，线索中断。
57-58
服部破解柯南身份，二人开始合作。
128-129
琴酒杀害明美。志保服药变小并逃离组织寄住博士家，化名灰原哀转入帝丹小学。
170-171
柯南解决医生新出智明的父亲被杀一案。
176-178 哀的身份被组织成员皮斯克发现，后被柯南所救。皮斯克因办事不力被boss命令枪杀。贝尔摩得息影并在日本定居。
- 茱蒂追查贝尔摩得来到日本，以帝丹高中英语老师的身份潜伏下来。
贝尔摩得制造车祸企图害死新出一家，但新出家被FBI暗中保护下来。贝尔摩得开始假冒新出医生的身份。
226-227
茱蒂与柯南相识，并发现他非同一般。
230-231
少年侦探团和博士一行在公车上遇到茱蒂、新出、秀一。哀感到车上有组织成员变得非常害怕，准备一死了之，被柯南救下。秀一打电话表示正在监视某人。
253-254
假新出可能发现了柯南分析案情并利用变声器。
258-259
詹姆斯·布莱克与柯南等人结识，后被秀一接走。詹姆斯也发现柯南不一般。
269-270
高木涉刑警提到与小五郎相关的案卷被偷，后又被送回。秀一监视毛利侦探事务所。
271-272
茱蒂在谈话中提到了FBI。贝尔摩得发邮件给琴酒，提到了雪莉，并向打了叉的志保照片投飞镖，旁边还有柯南和兰的照片。
277-278
案卷的丢失让柯南不安。他基本肯定克丽丝是组织的成员，并进一步怀疑茱蒂是克丽丝。服部鼓动柯南去茱蒂的公寓试探，但没有收获。最后茱蒂浴室的镜子后面出现柯南和兰的照片，且照片上的字迹和贝尔摩得的一模一样（后续剧情表明，这是茱蒂曾潜入假新出的房间，发现相关的照片后复制的，同时茱蒂也借此知道了贝尔摩得的目标是哀）。另外柯南最后说的除茱蒂外的另两个可疑人物应是秀一和新出。
289-290
哀提到沼渊己一郎曾是组织成员。
307-311
小五郎受托寻找失踪的电脑工程师板仓卓。从委托人的谈话中柯南了解到他就是龙舌兰接触的对象，但板仓已身亡。柯南获得板仓的日记，里面提到组织的庞大计划甚至可能“影响到人类的前途，要使时光倒流”。柯南试图冒充板仓与伏特加接头，但被琴酒识破而失败，险些被抓。
329-330
博士提到厚司是有名的疯狂科学家，而艾莲娜是英国留学生，组织可能正在从事让死人复活的计划。
335-336
柯南和哀都被秀一跟踪。由于哀与照片中的人物相似，因此FBI猜测她就是贝尔摩德的目标。秀一对着哀的照片说了一句“真是太像了”。
338-339
哀患感冒，送医途中遇到茱蒂，秀一也跟踪而来。博士借茱蒂的车将哀送回家，并找新出给哀看病。贝尔摩德发现哀下落，并在博士家安了窃听器。
340-341
柯南找到明美所藏、艾莲娜留给哀的录音带，还没怎么听就交给哀。录音中提到了某件令哀震惊的事。
贝尔摩德找卡尔瓦多斯来帮忙策划行动。
343-344
茱蒂辞去教师职务。兰在茱蒂家意外发现镜后的照片。
345
贝尔摩德利用幽灵船活动邀请了小五郎、新一和琴酒，试图调开柯南而刺杀哀；茱蒂了解到了这个计划，抢先一步接走哀并试图将贝尔摩德引入陷阱，但贝尔摩德将计就计作了安排；另一方面，柯南邀请服部化妆成新一赴会，而自己在有希子的帮助下化妆成哀试图和组织接触；哀不放心柯南去，跟踪前往；兰因想了解茱蒂的真正身份躲在了茱蒂汽车的后备箱里，并在最后关头救了哀。贝尔摩德不让卡尔瓦多斯向兰开枪，并叫兰Angel。卡尔瓦多斯自尽。贝尔摩德逃脱赤井的追捕，并向组织其他人隐瞒了柯南和哀的事。柯南听到了贝尔摩德给组织Boss“那位先生”发邮件时的按键音。
346-347
茱蒂设法瞒过了兰。哀拒绝证人保护计划。
361-362
真正的新出回归。
374-375
385-387
394-396
柯南在一系列案件中发现按键声的旋律为《七个孩子》，并推出Boss的邮箱地址。
425
柯南发现水无怜奈为组织成员基尔，之后与FBI阻止了组织暗杀土门康辉和小五郎的行动。水无重伤昏迷，被FBI控制在杯户中央医院。
429
本堂瑛祐转到兰的班上。
462-465
贝尔摩得去水无出事目击者家调查，引起柯南注意；瑛祐在到毛利侦探事务所做客时刻意把话题引向水无，并希望柯南等人前去调查，引起柯南的警觉。组织加紧搜寻水无，琴酒初次提到了卧底于组织的人物（即后来的本堂姐弟二人的父亲伊森·本堂）。
484-485
柯南得到一张瑛祐父亲的照片。瑛祐及水无的身份逐渐清晰。
491-492
495-504
瑛祐总给柯南不好的感觉，他四处寻找自己的姐姐——与水无长相完全相同的本堂瑛海，怀疑水无是藏起自己姐姐的坏人。
组织派楠田陆道混入杯户中央医院调查。水无承认为CIA卧底和瑛祐的姐姐瑛海，同为CIA的父亲也是CIA的卧底，4年前为掩护瑛海殉职，并答应柯南、秀一的计划。楠田自尽，水无按计划回到组织，为取得组织信任“枪杀”秀一。
507-508
瑛祐得知柯南身份，之后留学美国。
509
水无急报组织派出了厉害的侦探波本。
510-511 冲矢昴在柯南的允许下住进新一家，但哀对冲矢产生对组织的反应。冲矢的推理能力很强，是左撇子，爱喝波本酒。
563-564
疑似秀一的伤疤男出现，开枪救了柯南。FBI提及秀一爱喝波本酒。
578-581
伤疤男再现，将在商场发生的案件的推理用别人的手机发给小五郎。同时茱蒂在商场收到了“这里很危险，快逃”的提醒。琴酒等人赶到，伤疤男在被瞄准时露出诡异的笑容，贝尔摩得带来Boss的撤退命令。
646-647
自称侦探的世良真纯转到兰的班上，对新一的能力似乎很有兴趣。
648-650 柯南发现世良很像一个人，并觉得世良对自己很在意，但认为世良不是坏人。
651 茱蒂、卡迈尔感觉世良很像某个人；詹姆斯则一眼看出世良是女孩。
656-657
世良对哀表现出兴趣，并打听冲矢的情况。
667-668
自称侦探的安室透登场，事件解决后主动拜小五郎为师。
671-674
安室、世良、冲矢参与从强盗手中救出柯南的行动。事后贝尔摩得联络波本，认为波本已取得毛利一行人充分信任。似乎波本就是这三人其中之一。
冲矢的一句“不要露出那种表情”让哀相当在意。
675-676
世良表示自己认识一个“从来不笑的人”，在注意到伤疤男的存在后对其相当关注。
哀想起冲矢的那句话和曾在组织卧底的诸星大（即秀一）的用语十分相似，之后哀对冲矢逐渐信任。
681-683 安室为高木的指导警官伊达航扫墓，暗示安室与伊达曾是朋友。
684-685 哀感觉冲矢的颈部藏着某个秘密。
690-691
世良在新一家发现女性线索，冲矢因此被怀疑真实身份。后根据柯南的叙述得知女性线索柯南为有希子所留。冲矢得知柯南真实身份。最后世良含泪回望柯南和兰，内心独白“果然我是个坏孩子呢”。
699-700
哀为救步美三人而短暂恢复为志保，结果被世良、安室、冲矢得知志保将搭乘神秘列车。
701-704 组织计划在神秘列车上杀死雪莉，但被柯南委托基德假扮所救。 赤井确认为世良的大哥，安室确认是波本。列车停靠后贝尔摩得发现雪莉未死，但没有告诉其他组织成员。安室对赤井之死产生怀疑，准备重新调查。冲矢昴露出与赤井秀一相同的眼神。
706 安室发现柯南使用麻醉针。贝尔摩得劝安室离开毛利，安室拒绝并称对“沉睡的小五郎”产生兴趣。
723 安室救少年侦探团于险境，冲矢通过楼上的窗户目送他离开。
724-725 世良重提“神秘列车”上帽子丢失的事情，询问小兰有没有见到“伤疤赤井”。
727-728
兰回忆起似乎与世良见过，而且与涟漪有关。
731-732 宫本由美的前男友将棋高手羽田秀吉表现出很强的记忆推理能力，还知道柯南不一般。
734 柯南告诉茱蒂伤疤赤井为波本假扮，请她调查安室未离开波洛咖啡厅的原因。波本窃听柯南和朱蒂的对话，称柯南为“可怕的男人”。
739 柯南通过与高木警官的对话发现神社事件中赏樱游客弁崎桐平和其“妻子”为波本和贝尔摩得假扮。
744-745 世良提到自己的二哥，世良与二哥似乎知晓柯南身份，二哥询问世良是否见到了“魔法师”。
756
759-760 世良有意让柯南看到自己与一位神秘少女的合影。少女身体虚弱，与世良相像，要求世良称其为“领域外的妹妹”，并破坏了柯南安装的窃听器。
770-771 波本到杯户中央医院调查楠田陆道之死，获取了其死亡车辆中有手枪血迹的情报，提到自己幼年的外号“零”，回忆中出现长发女性。
779-783
波本在贝尔摩得的帮助下套出楠田在车内开枪自杀的情报，调查后突袭工藤宅，面对冲矢昴说出了赤井假死过程和伪装身份的推理。同时赤井在来叶山路现身，揭晓了波本的真名和公安警察卧底身份。冲矢昴确认为秀一易容，并送出基尔发来的朗姆出动的急报。
786-787 “领妹”和冲矢昴都很关心羽田秀吉的比赛情况。世良邀请柯南到访，“领妹”表示柯南未必符合她的期待。
792-793 哀透露朗姆为组织No.2，一只眼为义眼。
827-828 柯南发现世良或“领妹”的本名可能为“Mary”。
837 安室回忆赤井杀死了公安卧底苏格兰。
844 柯南发现哀与“领妹”长相相似。
850
861-864
866-867
哀提到羽田秀吉的义兄羽田浩司是APTX4869名单上一员。柯南和赤井推理认为浩司被朗姆嫌疑人浅香杀害。世良与“领妹”都很关心浩司案件。
“领妹”得知柯南使用变声器破案，世良称其为“妈妈”。
贝尔摩得与波本刺探疑似与浅香有关的歌词，但其与组织无关。
1、(1) 云霄飞车杀人事件
54、(56) 电玩公司杀人事件
118、(124~125)浪花连续杀人事件
128、(135)黑衣组织十亿元抢劫事件、(部分情节为动画原创)
129、(136~139)来自黑衣组织的女子 大学教授杀人事件
176、(190)与黑衣组织的再会、(灰原篇)
177、(191)与黑衣组织的再会、(柯南篇)
178、(192)与黑衣组织的再会、(解决篇)
230、(249)神秘的乘客、(前篇)
231、(250)神秘的乘客、(后篇)
271、(293)急忙掩饰的忽略、(前篇)
272、(294)急忙掩饰的忽略、(后篇)
286、(308)工藤新一纽约事件、(事件篇)
288、(310)工藤新一纽约事件、(解决篇)
289、(311)光彦森林迷失记、(前篇)
290、(312)光彦森林迷失记、(后篇)
307、(332)遗留的无声证言、(前篇)
308、(333)遗留的无声证言、(后篇)
309、(334)与黑衣组织的接触、(交涉篇)
310、(335)与黑衣组织的接触、(追迹篇)
311、(336)与黑衣组织的接触、(决死篇)
338、(363)四辆保时捷、(前篇)
339、(364)四辆保时捷、(后篇)
340、(365)厕所里隐藏的秘密、(前篇)
341、(366)厕所里隐藏的秘密、(后篇)
345、(371~375)与黑衣组织的直面对决 满月之夜的双重谜案
425、(459~463)黑暗冲击!黑衣组织的魔爪伸来的瞬间
462、(502)黑衣组织的影子 年幼的目击者
463、(503)黑衣组织的影子 奇妙的照明
464、(504)黑衣组织的影子 谜样的高额报酬
465、(505)黑衣组织的影子 珍珠的流星
484、(527)黑色照片的去向、(前篇)
485、(528)黑色照片的去向、(后篇)
491、(538)红与黑的碰撞 开端
492、(539)红与黑的碰撞 血缘
493、(540)红与黑的碰撞 绝叫
494、(541)红与黑的碰撞 冥土
495、(542)红与黑的碰撞 昏睡
496、(543)红与黑的碰撞 侵入
497、(544)红与黑的碰撞 觉醒
498、(545)红与黑的碰撞 搅乱
499、(546)红与黑的碰撞 伪装
500、(547)红与黑的碰撞 遗言
501、(548)红与黑的碰撞 嫌疑
502、(549)红与黑的碰撞 洁白
503、(550)红与黑的碰撞 决死
504、(551)红与黑的碰撞 殉职
563、(614)侦探团VS强盗团、(骚动)
564、(615)侦探团VS强盗团、(沉默)
578、(629)召唤危机的红色前兆
579、(630)黑与13的暗示
580、(631)逼近的黑色时刻
581、(632)红色的摇摆目标
667、(719)婚礼前夜、(前篇)
668、(720)婚礼前夜、(后篇)
671、(723)侦探们的夜想曲、(案件)
672、(724)侦探们的夜想曲、(绑架)
673、(725)侦探们的夜想曲、(推理)
674、(726)侦探们的夜想曲、(波本)
681、(733)以性命为赌注的恋爱转播、(转播开始)
683、(735)以性命为赌注的恋爱转播、(现场突入)
699、(751)逼近灰原秘密的黑影、(前篇)
700、(752)逼近灰原秘密的黑影、(后篇)
701、(753)漆黑的特快列车、(发车)
702、(754)漆黑的特快列车、(隧道)
703、(755)漆黑的特快列车、(交叉)
704、(756)漆黑的特快列车、(终点)
705、(757)密室中的柯南
706、(758)解谜的波本
722、(774)香甜冰凉的快递、(前篇)
723、(775)香甜冰凉的快递、(后篇)
734、(786~787)茱蒂的追忆与赏花的陷阱
739、(792)小五郎在酒吧里、(后篇)
740、(793)小兰也倒在浴室里了、(前篇)
770、(823)气氛僵硬的茶会、(前篇)
771、(824)气氛僵硬的茶会、(后篇)
779、(832)绯色的序章
780、(833)绯色的追寻
781、(834)绯色的交错
782、(835)绯色的回归
783、(836)绯色的真相
813、(868) 悄悄靠近安室的黑影
836、(891) 关系不好的女子乐队、(前篇)
837、(892) 关系不好的女子乐队、(后篇)
扩展资料：
角色能力
柯南推理水平极高，足球同样水平一流，初中时是足球队的中锋，球衣是10号，曾被专业球队邀请，但新一却说“足球只是放松的方式”而未在足球方面继续发展。
其他运动也很在行，例如滑板、滑雪等。擅长射击、驾驶（汽车、飞机、直升机、快艇等，都是优作教的，见M 2、M 5等）、拆弹、绝对音感、小提琴、多种外语（作者青山曾表示新一会多种外语）、电脑（M 10）等。
会拉小提琴，但不是非常专业的水平，自称小提琴只是“破案之余的爱好”。而且对小提琴方面的知识相当熟悉，原因是福尔摩斯擅长小提琴。不过拉小提琴方面有某个怪癖，小兰可以因此分辨出是新一在拉琴，但作品具体未揭晓。
对于棋牌类也很精通（TV 75中，小五郎打麻将时，帮其解围）。
不擅长唱歌总走调（但有绝对音感） [20] 、网球（OVA 2，和毛利兰对打0：40）、棒球（TV 383、651）、电玩（M 6等）、料理（TV 406，和服部平次切黄瓜没切断）、钓鱼（TV 352~353）等。
