主要面临六个挑战，具体如下：
（1）实现首次径向停靠空间站。此次神州十三号的对接方式将采用自主快速交会对接方式，这是与神舟十二号以及以往的飞行任务都有很大区别的地方。从某种程度上来说，这是它需要解决的第一个技术类问题，也算是第一个比较大的挑战。
（2）实现四个飞行器（也即一艘载人飞船，两艘货运飞船加上核心舱）组合运行。因为涉及的飞行器比较多，各方面的耦合也显得比较重要，这算是第二个比较大的挑战。
（3）实现我国女航天员首次进驻中国空间站，并且出舱。就目前而言，这个操作还是没有的。也就是说，这一项任务能不能完成，决定了是否能实现一个里程碑式的进步。
不过个人觉得既然男子可以，想必女子也不会有什么大的问题。而且王亚平本身也不是第一次执行飞行任务，这件事对她来说应该比较小case。
（4）继承神舟十二的事业，进一步开展各种科学实验，为我国科学技术增光添彩。相对来说，这个任务是没有难的。只是要在神舟十二的基础上，取得一些新的发现和研究成果，可能还是需要付出更多的努力。
（5）实现状态转换的可操控性，以及提升状态转换的效率。也就是说，实施任务的飞船以及火箭能够直接从应急待命的备份状态转变为发射状态。（听上去很高端的样子，不知道是否意味着以后实现状态转换自由？）
（6）进行首次长达六个月的在轨驻留，要完成这个任务，必须要求各方各面都有很严苛的保障。首先是宇航员本身的健康保障，在发射之前都有进行比较仔细的健康检查。
除此之外，各种仪器的精细程度以及各类应急方案都必须做到万无一失。6个月的时间听上去不长不短，但是一想到其实是半年，就觉得还是蛮强的。
以上即为神舟十三号任务面临的一些重要挑战。但是就以往神舟号的出色表现来看，这些挑战应该也不是问题，毕竟我国航天事业有着有目共睹的进步，相信在这种发展力度下，航天事业只会越来越好。
此处有彩蛋：因为长达六个月，也就是说，过年的时候他们仍然在太空哦，今年的春晚，没准还能实现太空对话~
- 一是载人飞船将采用自主快速交会对接的方式，首次径向停靠空间站。二是届时中国空间站将实现核心舱，艘货运飞船、1艘载人飞船共4个飞行器组合运行。三是航天员将首次在轨驻留6个月。四是中国女航天员将首次进驻中国空间站，航天员王亚平也将会成为中国首位实施出舱活动的女航天员。五是在神舟十二号任务的基础上，将进一步开展更多的空间科学实验与技术试验，产出高水平科学成果。六是实施任务的飞船、火箭均在发射场直接由应急待命的备份状态转为发射状态。
二是届时中国空间站将实现核心舱、2艘货运飞船、1艘载人飞船共4个飞行器组合运行；
三是航天员将首次在轨驻留6个月；
四是中国女航天员将首次进驻中国空间站，王亚平将成中国首位出舱的女航天员；
五是在神舟十二号任务的基础上，进一步开展更多的空间科学实验与技术试验，产出高水平科学成果；
六是实施任务的飞船、火箭均在发射场直接由应急待命的备份状态转为发射状态。
