有区别，两者是两个不同的大学。
厦门大学由著名爱国华侨领袖陈嘉庚先生于1921年创办，是中国近代教育史上第一所华侨创办的大学，是国内最早招收研究生的大学之一，中国首个在海外建设独立校园的大学，被誉为“南方之强”。学校直属教育部，中央直管副部级建制，是综合性研究型全国重点大学。
集美大学地处福建省厦门市，是福建省重点建设高校，交通运输部与福建省、国家海洋局与福建省、福建省与厦门市共建高校，福建省“一流学科”建设高校，博士学位授予单位，硕士研究生推免单位，国家“卓越工程师教育培养计划”试点高校，国家“卓越农林人才教育培养计划”试点高校。
