Question

如何寻找一个基因promotor区结合的蛋白

Answer 1

作为蛋白质的转录因子从功能上分析其结构可包含有不同区域：①DNA结合域（DNAbindingdomain）,多由60-100个氨基酸残基组成的几个亚区组成；②转录激活域（activatingdomain）,常由30-100氨基酸残基组成,这结构域有富含酸性氨基酸、富含谷氨酰胺。去blast里面查询，SpecializedBLAST里面的“SearchproteinornucleotidetargetsinPubChemBioAssay”，点击protein链接，把序列输入里面查询就可以了。结构域是生物大分子中具有特异结构和独立功能的区域,特别指蛋白质中这样的区域。