第二代基因测序产品研发主要面临哪些问题
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1)测序文库构建(Library Construction)
首先准备基组(虽测序公司要求品量要达200ngGnome Analyzer系统所需品量低至100ng,能应用品限实验)DNA随机片段化几百碱基或更短片段并两加特定接(Adaptor)转录组测序则文库构建要相麻烦些RNA片段化需反转cDNA加接或者先RNA反转cDNA再片段化并加接片段(Insert size)于面数据析影响根据需要选择于基组测序说通选择几种同insert size便组装(Assembly)候获更信息
2)锚定桥接(Surface Attachment and Bridge Amplification)
Solexa测序反应叫做flow cell玻璃管进行flow cell细8Lane每Lane内表面数固定单链接述步骤带接DNA 片段变性单链与测序通道接引物结合形桥状结构供续预扩增使用
首先准备基组(虽测序公司要求品量要达200ngGnome Analyzer系统所需品量低至100ng,能应用品限实验)DNA随机片段化几百碱基或更短片段并两加特定接(Adaptor)转录组测序则文库构建要相麻烦些RNA片段化需反转cDNA加接或者先RNA反转cDNA再片段化并加接片段(Insert size)于面数据析影响根据需要选择于基组测序说通选择几种同insert size便组装(Assembly)候获更信息
2)锚定桥接(Surface Attachment and Bridge Amplification)
Solexa测序反应叫做flow cell玻璃管进行flow cell细8Lane每Lane内表面数固定单链接述步骤带接DNA 片段变性单链与测序通道接引物结合形桥状结构供续预扩增使用
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