有一定区别。首先A站是先来的，B站是后到的。A站全称“ACFUN”，建立于2007年，是国内最早也是当时规模最大的二次元弹幕视频网站，针对二次元人群的兴趣、涉猎范围而建立的专业的大型视频网站。而B站全称“bilibili弹幕网”，2009年成立，其实最初两家网站说穿了都是做做“搬运”的事情，性质是一样的。所谓的“搬运”就是搬运NicoNico动画这个日本视频网站上的作品，因为NicoNico动画的视频在国内没法直连观看，那些用缓存的办法下载好Nico视频上的精彩视频的朋友，再重新上传到国内的A站，或者B站，这个就叫“搬运”，最初两家网站都是以搬运视频为热点的，后来人渐渐多了，就不全是搬运了，而是做做符合国人口味的二次元相关的视频，如动画的MAD，游戏恶搞视频等等。
再来说说两者的区别，一个是运营情况，现在来说，我觉得绝大多数人都会更加认同B站，虽然B站后到，但是劲头足，运营的好，各种活动年年搞，影响力大，因此也获得更多的投资，良性循环；相对的A站，运营的不好，投资也少了，人气也没B站高，因此现在渐渐不如刚出来的时候一片红的景象了。
从内容上来说，A站目前个人感觉更加偏向游戏、娱乐、二次创作，八卦等；B站偏向动画番剧。和围绕二次元的二次创作作品，游戏直播也不少。B站现在拿下正版版权甚至独播版权的动画片资源非常多，A站那里二次创作，游戏恶搞视频等比较多。
虽然现在A站没落了，但是当时也有很多经典作品，例如《元首》系列的恶搞，《金坷垃》，《滑板车》等等，现在想想反而是B站更热，让人唏嘘不已。
