Question

怎样用perl把fasta文件中的多条序列分别处理？

比如有序列：
>gi| test
KHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
CCCGGG
LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
>gi| test
MHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
CCCGGG
NHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
我想一次处理一条，应该怎么写？

Answer 1

你指的每个序列都是以>gi| test开头的么？

那可以按行读进来，判断该行是否是>gi| test，如果是，接下来的每一行都单独处理，直到读到下一个>gi| test为止。