mRNA在转录的时候以DNA的哪一条链为
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反义链和有义链（sense strand）在以前的概念和现今的使用之间存在有一些混乱,从概念上说在基因的DNA双链中,转录时作为mRNA合成模板的那条单链叫做模板链或反义链（template or sense strand）,而转录时不能作为mRNA合成模板的那条单链叫有义链,但为了使用上的方便,现今通常将mRNA看作是有义分子（sense molecule）而将与mRNA序列一致的DNA单链（假定DNA中的T替代mRNA的U）标为有义链,在文献中,这条与mRNA序列一致的DNA单链序列被用作基因序列.该序列的5’端称之为上游（upstream）3’端称之为下游（downstream）.
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