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辣椒茎基腐病多在进入结果期时发病，仅为害茎基部。发病初期，茎基部皮层外部无明显病变，而后茎基部皮层逐渐变为淡褐色至黑褐色，绕茎基部一圈，病部失水变干缩。病部以上叶片变黄，萎蔫。后期叶片变为黄褐色，枯死多残留在枝上不脱落。根部及根系不腐烂。后期，病部表面常形成黑褐色大小不一的菌核，可以用恶霉灵，氯溴异氰尿酸，五氯硝基苯，腐霉利，枯草芽孢杆菌，甲基立枯磷淋根茎防治
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