细菌DNA提取各步骤和目的,能详细的教一下吗

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神里流霜灭
2018-05-02 · TA获得超过2989个赞
知道小有建树答主
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TE是用来浮起细菌的。如果是阳性菌的话最好是用溶菌酶处理一下。
SDS可以让细胞裂解,并与核蛋白结合(当然也包括DNA)。蛋白酶K自然是降解蛋白的。到这一步可以直接用异丙醇沉淀,70%乙醇洗一次(洗去少量的盐分)。凉得差不多再用少量TE溶解就得到DNA了。
当然,在蛋白酶K处理过后,也可以用1.4M NaCl沉淀一下蛋白(DNA在此浓度溶解度增加,而蛋白减小)。或者用酚:氯仿:异戊醇(25::24:1)PH>7.8抽提,去蛋白。其后依旧用异丙醇沉淀,70%乙醇洗。
CTAB/NaCl功能与SDS相当,但一般用于提取植物基因组。
中科雷鸣
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本回答由中科雷鸣提供
匿名用户
2019-03-18
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BIOG离心柱法提取细菌DNA
自行准备材料:无水乙醇、PBS水及1.5mL离心管。
取出析出液和洗涤液,按以下操作:
a) 析出液:4.5mL加入25.5mL无水乙醇;9mL加入51mL无水乙醇。
b) 洗涤液:9mL加入21mL无水乙醇;18mL加入42mL无水乙醇。
c) 配制好的析出液如出现沉淀,可在37℃溶解,摇匀后使用。
细菌处理:将收集的细菌5,000 rpm离心3分钟,弃上清,加入200μLPBS,振荡混匀,5,000 rpm离心3分钟,彻底弃上清。
a) 对于革兰氏阴性菌和一般的革兰氏阳性菌,加入200μL裂解液Ⅰ,悬浮沉淀,37℃放置30分钟。
b) 对于细菌壁较厚的革兰氏阳性菌、真菌、细菌芽孢等须首先自行进行破壁处理,处理结束后进行步骤5操作。
加入200 μL 裂解液Ⅱ,20μL消化液,充分振荡混匀,56℃水浴10 分钟。
加入600μL析出液,轻轻颠倒混匀,如有半透明悬浮物,不影响DNA的提取与后续实验。
将吸附柱放入收集管内,取上述溶液600μL转入吸附柱内,静置2 分钟,12,000 rpm 4℃离心1 分钟,弃收集管内废液。
将剩余400μL液体转入上述吸附柱内,重复操作步骤7。
将吸附柱放回收集管内,加500μL 洗涤液至吸附柱内,12,000 rpm 4℃离心1 分钟,弃收集管内废液。
将吸附柱放回收集管内,12,000 rpm 4℃离心2 分钟,离去残留的洗涤液。
取出吸附柱,放入新的1.5 mL 离心管内,加入50-200 μL 洗脱液,静置3分钟,12,000 rpm 4℃ 离心2分钟,收集DNA溶液。提取的DNA即可用于下一步实验或-20℃保存
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