Question

求一个用perl语言写的程序

用perl语言写的程序，具体内容是将序列格式进行转换，比如将蛋白质序列转换为FASTA格式。
写好后有加分
哎，没人回吗？

Answer 1

这个用bioperl来做非常简单，但有一些模块需要你自己安装。这就需要你熟悉cpan上模块的安装。或者参见我空间里bioperl安装的内容。

这里直接用到的就是Bio::SeqIO module,但它可能依赖于一些相关模块，所以最好装全bioperl。

装好之后就可以用下面的script。

#!/usr/bin/perl # the directory of you perl binary file
use strict;
use warnings;

my $in = Bio::SeqIO->newFh(-file => "inputfilename" ,
-format => 'swiss');
my $out = Bio::SeqIO->newFh(-file => "outputfilename",
-format => 'fasta');
print $out $_ while <$in>;
# 注意根据你的需要改变-file和-format的参数值。
# good luck

Answer 2

请提供具体实例和计算公式！

不太了解蛋白质序列和FASTA格式

只知道蛋白质是由氨基酸和多肽组成的三级结构。

Answer 3

什么意思？
蛋白质序列是像这样的吗？DASFASFEAFDDFSA。。。
FASTA的写成：
>title
DASFASFEAFDDFSA。。。
是这个意思吗？
你从NCBI上下载下来的序列就是FASTA格式了