有必要了解下基因表达调控
染色质的主要结构元件是 核小体 ，核小体的核心区是 4种组蛋白 （H2A、H2B、H3、H4各2个分子）组成的八聚体，然后外面缠绕DNA双螺旋。其中每个组蛋白分子的氨基都会伸出核小体外 ，形成 组蛋白尾巴 【这些尾巴可以联系核小体，同时也是 组蛋白修饰位点 （修饰包括对组蛋白中富含的赖氨酸、精氨酸、组氨酸等带正电荷的碱性氨基酸进行的 乙酰化、磷酸化和甲基化 等过程）】
基因被激活时，染色质中核小体结构变得松弛，降低了核小体对DNA的亲和力，易于基因转录。
染色质水平控制基因转录的过程中，一个比较重要的机制就是 DNA甲基化 ，这也是目前研究比较广泛的。甲基化 简单说就是 ：胞嘧啶的第5位碳原子可以在DNA甲基转移酶（DNA methyltransferase）作用下被甲基化修饰为5-甲基胞嘧啶，常发生在CG序列中。另外，甲基化胞嘧啶在基因组的分布不均匀，有的地方含量比较高，一般将 GC含量达60%，长度在300-3000bp 的区段叫做 CpG岛 。CpG岛主要在基因的 启动子和第一外显子 区域，大概超过60%的基因的启动子有CpG岛。染色质在 转录活跃状态时，CpG岛的甲基化程度下降 （如：管家基因的CpG岛中胞嘧啶甲基化水平较低）【CpG岛的 高甲基化促进染色质形成致密结构 ，不利于基因表达】
染色质水平上的调控可以遗传给子细胞，原因就是细胞内存在具有维持甲基化作用的DNA甲基转移酶，可以在DNA复制后，按照亲本DNA链的甲基化位置对子链DNA的相同位置进行甲基化修饰【像这种遗传信息不在DNA中，而通过影响染色质结构及改变基因表达的方式，就是目前研究火热的 “表观遗传”（epigenetics） 】
对于真核生物来讲，必须知道一个东西： 顺式作用元件 （cis-acting element） 。它位于编码基因两侧，是可以影响自身基因表达活性的DNA序列，常常是 非编码序列 。真核基因组中的每一个基因都有自己特异的顺式作用元件，一般分为启动子、增强子、沉默子等
一般包括转录起始点以及上游100-200bp的序列，包括许多功能独立的DNA序列元件，每个元件7-30bp左右。
众多的功能元件中，最经典的是 TATA box ，它的共有序列是TATAAAA，一般位于转录起始上游-25~-30bp区域，是基本转录因子TF II D的结合位点。除了TATA，还有GC box（GGGCGG）、CAAT box（GCCAAT）
长度大约200bp，顾名思义，就是增强转录效率（百倍以上）。核心组件常为8-12bp，单拷贝或多拷贝串联形式存在，另外也包含许多功能组件。增强子和启动子经常交错覆盖或连续排布。一般有以下的功能：
属于负调控元件，作用不受序列方向影响，也能远距离起作用，可以对异源基因起作用
转录因子（transcription factor， TF）是真核基因的 转录调节蛋白 。大多数的转录因子由其编码基因表达后，进入细胞核，然后识别、结合特异的顺式作用元件从而增强或降低相应基因的表达。
转录因子一般分为 ：通用转录因子和特异转录因子
RNA聚合酶介导基因转录时必需的一类辅助蛋白，帮助聚合酶与启动子结合并起始转录【对 所有基因都必需，没有组织特异性 ，因此也叫“基本转录因子”】
个别基因转录需要，有的起转录激活作用（“ 转录激活因子 ”），有的转录抑制（“ 转录抑制因子 ”）。转录激活因子一般是一些增强子结合蛋白（enhancer binding protein, EBP）；多数转录抑制因子是沉默子结合蛋白，当然还有不依赖DNA起作用的，比如通过蛋白-蛋白互作来“中和”转录激活因子，降低它们在细胞内的有效浓度，从而抑制基因转录。
关于结构 ：大多转录因子是DNA结合蛋白，至少有两个不同的结构域： DNA结合域（DNA binding domain）和转录激活域（activation domain） 。其中DNA结合域主要有锌指模体（zinc finger）、碱性螺旋-环-螺旋（bHLH）、碱性亮氨酸拉链（bZIP）；转录激活域分为：酸性激活结构域（与 TF II D协助）、谷氨酰胺富含结构域（与GC box结合）、脯氨酸富含结合域（与CAAT box结合）
在所有RNA分子中，mRNA寿命最短。真核生物的mRNA半衰期差别很大，长的有数十小时，短的只有几十分钟。一般半衰期短的mRNA多为编码调节蛋白，受环境变化大。总体上，影响mRNA稳定性的因素主要有：
转录产生的mRNA前体包含内含子、外显子。一般需要剔除内含子后变成一个成熟的mRNA，然后被翻译成多肽链。但实际上，参与拼接的外显子可以不按在基因组上的线性分布次序拼接，并且内含子也可以不完全切除。
选择性剪切的结果是 ：同一条mRNA前体产生了不同的成熟mRNA ，并因此产生了不同的蛋白，这些蛋白的功能可以完全不同。
目前关于 内含子的功能 也是一个研究的方向，例如细菌丢失内含子，可以使染色体变小而加快复制速度；真核生物保留内含子，可以产生外显子移动，利于真核生物在环境改变时，合成功能不同但结构上仅有微小差别的蛋白
