设有标准设计研究所、工程设计研究所、工程技术咨询部、钢结构设计研究所、城市地下建筑设计研究所、信息技术研究所、建筑产品应用技术研究所、标准图发行部、标准图储运部、经营管理部、技术质量与研发部、市场管理部、财务部、人力资源部、院办公室等15个部门,并在新疆、西安等地设有办事处。
1993年和2003年还分别投资设立了北京国标建筑科技公司、北京金土木软件科技有限公司。
建设部建筑制品与购配件产品标准化技术委员会秘书处设在标准院。
中国勘察设计协会工程建设标准设计工作委员会设在标准院。
中国工程建设标准化协会建筑与市政产品应用分会设在标准院。