随手记的小知识

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温屿17
2022-07-13 · TA获得超过1.2万个赞
知道小有建树答主
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统计
Normalized for ... = Divided by
比如矫正头部大小 = 除以头部大小
MAD normalised = divided by MAD
MAD https://blog.csdn.net/horses/article/details/78749485

DWI
DWI是影像技术,DTI是对DWI的建模方法(所以最好不要说DTI影像)
b0其实也是有方向的(并不是[0,0,0],为Scanner需要输入方向),但是一般可以忽略掉
b值在bval文件里可能会上下浮动,比如b=1000实际是995 or 1005,这是正常的不用特别处理(FSL等软件已经做好优化了)

Seed
fMRI的seed一般不是一个voxel,而是一个区域

Template, atlas, mask and map
template模板是标准空间(一个标准脑)
atlas图谱是基于模板的对脑区的划分(一种划分图)
mask是重点区域的二值图像,这个区域可以是全脑也可以是ROI(二值图)
map是感兴趣的指标对每个体素的映射(一种映射图)

区分以下几种volume
intracranial cavity volume 颅腔容积
head size: 通常用于normalization (normalized for head size)
GM volume = peripheral cortical GMV + sub-cortical GMV
total brain volume = GM volume + WM volume

术语使用
配准register用于描述个体空间到标准空间的变换
对齐align描述把影像变换到个体空间
变换transform用法较广泛

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