Question

名词解释模体

Answer 1

模体，也叫模序，表示蛋白质中具有特定空间构象和特定功能的结构成分。

拓展资料：

模体(motif)表示具有特定功能的或作为一个独立结构域一部分的相邻的二级结构的聚合体，它一般被称为功能模体（functionalmotif）或结构模体（structuralmotif），相当于超二级结构（super-secondarystructure）。

模体和结构域一起组成了蛋白质的三级结构。结构模体作为结构域的组分，介于蛋白质二级结构和三级结构之间，由相邻的二级结构单元彼此相互作用，组合在一起，排列成规则的，在空间结构能够辨认的二级结构组合体，并充当三级结构的构件

其基本形式有αα、βαβ和βββ等。多数情况下，只有非极性残基侧链参与这些相互作用，而亲水侧链多在分子的外表面。

模体是刻画蛋白质家族组成结构和执行功能的重要部分，但是对于通过各种生物信息学方法识别出的模体，暂时没有很好的办法辨别真假和优劣。

提出一种新的模体评价策略，从分类器的观点出发，对不同方法在同一个蛋白质家族上建立的不同模体进行比较，从而推断出最具有生物意义的模体。在PROSITE数据库中选取7个细胞因子家族，采用MEME和HMMER两种模体识别方法分别识别每个家族的模体，将每个模体看作一个分类器

通过计算同一家族的每个模体的敏感性和特异性并比较它们对应的接收机操作特性曲线，进而比较不同模体，确定真的模体和排除假的模体，从而获得每个蛋白质家族的最佳模体的模型。这种策略可以应用于对任意蛋白质家族模体识别结果的评价。

此外，还可以利用最佳模体搜索数据库的结果预测每个家族的新成员。