SSR分子标记是怎样进行植物基因定位的
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2017-04-17
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SSR分子标记是怎样进行植物基因定位的
在真核生物的基因组中,每个SSR序列的基本单元重复次数在不同基因型间差异很大,因此形成其座位的多态性,并且每个SSR座位两端有一段保守的DNA序列,可以根据此保守序列设计引物,利用PCR技术进行扩增,然后用高浓度琼脂糖凝胶或变性聚丙稀酰胺凝胶电泳进行分析.由于SSR多态性是由简单序列重复次数的差异引起的,因此在扩增的PCR带上会出现小片段或不连续的带.由此可见,SSR分子标记的基本原理就是要了解SSR座位两侧的核苷酸序列,寻找其中的特异保护区.
在真核生物的基因组中,每个SSR序列的基本单元重复次数在不同基因型间差异很大,因此形成其座位的多态性,并且每个SSR座位两端有一段保守的DNA序列,可以根据此保守序列设计引物,利用PCR技术进行扩增,然后用高浓度琼脂糖凝胶或变性聚丙稀酰胺凝胶电泳进行分析.由于SSR多态性是由简单序列重复次数的差异引起的,因此在扩增的PCR带上会出现小片段或不连续的带.由此可见,SSR分子标记的基本原理就是要了解SSR座位两侧的核苷酸序列,寻找其中的特异保护区.
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