Question

第一次做生物信息学，求助

Answer 1

你这个问题好大，生物信息学包含的内容太多，主要看你需要做哪些分析，是想学习分析，还是只是需要发表论文，如果学习，那是一个系统的学习，推荐学习两门语言，R语言和PERL语言，学习两个数据库，GEO和TCGA，这两个数据库是现在的主流，需要掌握的。学习资源可以取生信自学wang和丁香园，都可以学到不少东西。如果是写论文，可以直接找生信分析的人，把分析好的数据和图片给你，你就可以写论文了，当然找人家做一般都是有偿的。

1. 学习语言：R

2. perl程序

两大数据库

1. GEO芯片数据库

2. TCGA癌症数据库，包括癌症的临床信息，表达信息，甲基化，SNP，数据量大，全面

Answer 2

(1)在公共DNA数据库（比如GenBank）中有多少玉米相关的条目（entries）？在数据库中与玉米相关数据中有多少Waxy (granule-bound starch synthase)基因序列？
(2)SSH实验得到了一个未知序列，请在公共数据库中找到最佳匹配（hit）（其实就是做比对，blast），然后预测潜在的功能。（结构相似性与功能相似性）
(3)用动态算法（指定了这个算法：Needleman-Wunsch algorithm）对以下序列进行全局比对，打分系统用BLOSUM50空位罚分8。（需要你去了解这个算法，然后用程序实现应用到比对中，最后得出最佳的匹案得到结果）
(4) 在竹子的基因组片段中找基因
(5) 在植物抗病基因中找一致性序列（domains/motifs）（这个你可以用寻找motif的工具，如MEME）
(6) 构建植物抗病基因的系统发生树
(7) 写一篇近两年关于谷物类基因或者人类基因组相关的综述。

P.S. LZ你这个是课程结束作业么，工作量不小啊