我们应该对哪些基因组进行测序,以及如何从序列中获得有价值信息?
首先是找仅包含一个基因组的细胞。标准的人类细胞包含两配仔渗组DNA,一个母体副本和一个父系副本,但该研究小组使用来自一组称为完整痣的细胞的DNA,其中包含一个父系DNA副本。完全性葡萄胎是一种罕见的妊娠并发症,由源自胎盘的细胞异常生长引起。这种方法简化了基因组,因此科学家只需要对一组DNA进行测序,而不是两组。
其次是由于我们的DNA是从我们的父母那里继承来的,所有人类基本上都携带两个基因组,一个来自他们的母亲,一个来自他们的父亲。反过来,每个父母都与他们的父母共享一个基因组,依此类推。考虑到其他亲戚,如兄弟、姐妹、叔叔、堂兄弟等,事情很快就会变得一团糟。毕竟,即使有问题的婴儿在国家数据库中拥有他们的基因数据会很好,但他们的祖父母可能并不那么热衷于此。
再者新的测序技术可以检测到最常见的突变,但对肿瘤细胞中存在的各种突变和多种基因组类型的分辨率并不高。长期以来,研究人员一直期望DNA测序分辨率可以降低到单细胞,这对于研究许多复杂生物系统中存在的细胞异质性非常重要,特别是对于研究人类肿瘤基因组混合物。
要知道培脊微生物几乎遍布地球的每个角落,它们对生态系统和宿主健康产生巨大影响。将生物数据与潜在遗传关系相结合的高通量测序技术的出现迅速提高了我们对微生物群落物种多样性的理解。尽管宏基因组测序让我们得以一窥复杂的戚歼微生物群落,但数据本身可能不完整且存在局限性。因此,在科学研究需要使用该技术时,对宏基因组测序的客观判断非常重要。
2024-11-29 广告