Question

列举三种研究DNA和蛋白质相互作用的方法，并比较其优缺点。

Answer 1

【答案】：(1)凝胶滞缓实验或称凝胶阻滞试验，蛋白质可以与末端标记的核酸探针结合，电泳时这种复合物比没有蛋白质结合的探针在凝胶中泳动速度慢，表现为相对滞后。
优点：不仅可以用来鉴定在特殊类型细胞的提取物中，是否存在着能够同某一特定DNA片段结合的蛋白质分子(比如特异的转录因子等)，而且还可以用来研究发生此种结合作用之精确的DNA序列的特异性。
(2)DNase Ⅰ足迹试验，蛋白结合在DNA片段上，能保护结合部位不被DNase破坏，这样，蛋白质在DNA片段上留下了“足迹”，在电泳凝胶的放射性自显影图片上，相应于蛋白质结合的部位没有放射性标记条带，出现一个空白区域。
优点：是一种测定DNA结合蛋白在DNA上的准确结合位点的技术。
(3)噬菌体展示技术，将编码“诱饵”蛋白的DNA片段插入噬菌体基因组，并使之与噬菌体外壳蛋白编码基因相融合。重组噬菌体侵染宿主细菌后，复制形成大量带有杂合外壳蛋白的噬菌体颗粒，直接用于捕获靶蛋白库中与“诱饵”相互作用的蛋白质。
优点：是一种经济高效的研究生物大分子相互作用的技术。如构建噬菌体随机多肽文库可用来筛选包括抗体小分子细胞表面受体等多种分子。