Question

转录因子的dna结合结构域不包含哪些结构

Answer 1

作为蛋白质的转录因子从功能上分析其结构可包含有不同区域：①
DNA
结合域
（
DNA binding domain
），多由
60-100
个氨基酸残基组成的几个亚区组成；②
转录激活域（
activating domain
），常由
30-100
氨基酸残基组成，这结构域有
富含酸性氨基酸、
富含谷氨酰胺、
富含脯氨酸等不同种类，
一酸性结构域最多见；
③连接区，
即连接上两个结构域的部分。
不与
DNA
直接结合的转录因子没有
DNA
结合域，但能通过转录激活域直接或间接作用与转录复合体而影响转录效率。

与
DNA
结合的转录因子大多以二聚体形式起作用，与
DNA
结合的功能域常见
有以几种：

①螺旋
-
转角
-
螺旋（
helix-turn-helix
，
HTH
）及

螺旋
-
环
-
螺旋
(helix-loop-helix
，
HLH
）

这类结构至少有两个
α
螺旋其间由短肽段形成的转角或环连接，两个这样的
motif
结构以二聚体形式相连，距离正好相当于
DNA
一个螺距
(3.4nm
）
,
两个
α
螺旋刚好分别嵌入
DNA
的深沟。

②锌指（
zinc finger
）

其结构如图

所示，每个重复的
“
指
”
状结构约含
23
个氨基
酸残基，锌以
4
个配价键与
4
个半胱氨酸、或
2
个半胱氨酸和
2
个组氨酸相结
合。
整个蛋白质分子可有
2-9
个这样的锌指重复单位。
每一个单位可以其指部伸
入
DNA
双螺旋的深沟，接触
5
个核苷酸。例如与
GC
盒结合的转录因子
SP1
中就有连续的
3
个锌指重复结构。

③碱性
-
亮氨酸拉链（
basic leucine zipper
，
bZIP
）

这结构的特点是蛋白质分子
的肽链上每隔
6
个氨基酸就有一个亮氨酸残基，
结果就导致这些亮氨酸残基都在
α
螺旋的同一个方向出现。
两个相同的结构的两排亮氨酸残基就能以疏水键结合
成二聚体，这二聚体的另一端的肽段富含碱性氨基酸残基，借其正电荷与
DNA
双螺旋链上带负电荷的磷酸基团结合。若不形成二聚体则对
DNA
的亲和结合力
明显降低。在肝脏、小肠上皮、脂肪细胞和某些脑细胞中有称为
C/EBP
家族的
一大类蛋白质能够与
CAAT
盒和病毒增强子结合，
其特征就是能形成
bZIP
二聚
体结构。