Question

ここで、ここに、ここは之间的区别是什么？

Answer 1

三者分别表示“在这里；在此”、“在这里；此处；此时”、“这里（是）”的意思。

ここで/に中的【で】和【に】均为介词，表示所处的空间、时间、地点等，均可翻译为“在……”；但两者又有细微区别，一般来说，【で】强调环境中发生的动态动作或偶然事件，而【に】强调环境中本身存在的静态事物。比如：
私はここで本を読む。（我在这儿看书。）
ここに花がある。（这儿长着花。）
ここに案内所がある。（这儿有问讯处。）
ここで集会がある。（这儿有个集会。）

而ここは中的【は】则是提示主语的助词，不单独翻译，与ここ及谓语动词连起来表示“这里（是）……（的地方）”，例如：
ここは教室です。（这里是教室。）
ここは花を植える场所です。（这里是种花的地方。）