RT -PCR的操作步骤
1. 总RNA的提取:见相关内容。
2. cDNA第一链的合成:目前试剂公司有多种cDNA第一链试剂盒出售,其原理基本相同,但操作步骤不一。现以长沙赢润生物技术有限公司提供的操作手册为例:
(1)在0.5ml微量离心管中,加入总RNA 1-5μg,补充适量的DEPC H2O使总体积达11μl。在管中加10μM Oligo(dT)12-18 1μl,轻轻混匀、离心。
(2)70℃加热10min,立即将微量离心管插入冰浴中至少1min。
然后加入下列试剂的混合物:
10×PCR buffer 2μl
25mM MgCl2 2μl
10mM dNTPmix 1μl
0.1M DTT 2μl
轻轻混匀,离心。42℃孵育2-5min。
(3)加入SuperscriptⅡ1μl ,在42℃水浴中孵育50min。
(4)于70℃加热15min以终止反应。
(5)将管插入冰中,加入RNase H 1μl ,37℃孵育20min,降解残留的RNA。-20℃保存备用。
3.PCR:
(1)取0.5ml PCR管,依次加入下列试剂:
第一链cDNA 2μl
上游引物(10pM) 2μl
下游引物(10pM) 2μl
dNTP(2mM) 4μl
10×PCR buffer 5μl
Taq 酶(2u/μl) 1μl
(2) 加入适量的ddH2O,使总体积达50μl。轻轻混匀,离心。
(3) 设定PCR程序。在适当的温度参数下扩增28-32个循环。为了保证实验结果的可靠与准确,可在PCR扩增目的基因时,加入一对内参(如G3PD)的特异性引物,同时扩增内参DNA,作为对照。
(4) 电泳鉴定:行琼脂糖凝胶电泳,紫外灯下观察结果。
(5) 密度扫描、结果分析:采用凝胶图像分析系统,对电泳条带进行密度扫描。
2024-11-04 广告