一、意思不同
足智多谋:智谋很多,形容善于料事和用计。
诡计多端:形容坏主意很多。
二、出处不同
1、足智多谋
出处:元·无名氏《连环计》第一折:“此人足智多谋,可与共事。”
释义:元·无名氏《连环计》第一折:“这个人善于料事和用计,可以与他一起做事。”

2、诡计多端
出处:《三国演义》第一一七回:“绪曰:‘维诡计多端;诈取雍州。’”
释义:《三国演义》第一一七回:“绪说道:‘只有用一些坏主意;才能夺取雍州。’”
三、成语用法不同
足智多谋:联合式;作谓语、宾语、定语;含褒义。
诡计多端:主谓式;作谓语、定语;含贬义。