请问用Linux或Perl如何从蛋白质序列文件中取出存储在另一个文件中的10个蛋白质ID的Fasta格式序列

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月轮天唯五
2016-06-22 · TA获得超过377个赞
知道小有建树答主
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#!/usr/bin/perl -w

use strict;
#contact perlcoder weixin
my %hash;
while(<DATA>)
{
    if($_=~/\S+/)
    {
        
    }
    else
    {
       next;    
    }
    chomp;
    my ($key)=$_=~/>(\S+)/;
    my $value=<DATA>;
    chomp($value);
    $hash{$key}=$value;    
}

print $hash{'Gh_A04G0739'},"\n";


__DATA__
>Gh_A12G2559              
ATGGCTACTTTCTTTGGCTATTTTAC
>Gh_A12G2554              
ATGGCGGGAACTATCCAATCCCTAAT
>Gh_A04G0755              
ATGGCCTCCGATCAGACCCTTTTTCA
>Gh_A04G0739              
ATGGAGAAAGCAAAACCTGAAGCACC
>Gh_A04G0738              
ATGGCGCAGGTTTTAGACGACGCTGA
>Gh_A07G1346              
ATGGTTCATTGTCTGCCAAAGGTTTC
>Gh_A07G1331              
ATGGCAGACAAGGATTCTTCAAGGCC
>Gh_A07G1334              
ATGACGACGCCAACTCGAGATGCAAT
>Gh_A07G1335              
ATGGCCGCAACTAGATTCCTCTCTCA
>Gh_A08G1510              
ATGGCTACTGCACCGATAAAGTCTCA
>Gh_A08G1433              
ATGGGTAAAACACCTACTGGCAAGGA
来自:求助得到的回答
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光点科技
2023-08-15 广告
通常情况下,我们会按照结构模型把系统产生的数据分为三种类型:结构化数据、半结构化数据和非结构化数据。结构化数据,即行数据,是存储在数据库里,可以用二维表结构来逻辑表达实现的数据。最常见的就是数字数据和文本数据,它们可以某种标准格式存在于文件... 点击进入详情页
本回答由光点科技提供
qmg1023
2016-06-20 · TA获得超过888个赞
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最好输入输出都有样例,贴出来。

否则无法给出答复
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