转录组高通量测序后的kegg的通路涉及到多少个基因可以直接用吗

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匿名用户
2017-06-25
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如何利用KEGG定位基因属于哪个代谢通路
代谢通路:目前在通路数据库(PATHWAY database) 中代谢通路是建立得最好的,有大约90个参考代谢途径的图形。每个参考代谢途径是一个由酶或EC号组成的网络。
利用如下方法可通过计算机构建出生物体特有 的代谢通路:
先根据基因的序列相似性和位置相关性确定基因组中酶的基因。
然后合理地安排EC号。
最后将基因组中的基因和参照通路中用EC号编号的基因产物 结合起来。
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