实时荧光定量pcr数据如何统计?
近日做实时荧光定量pcr,得到了不同的ct值,只是计算了△△ct以及2-△△ct的值,但是我不知道如何使用spss进行统计分析,看到别人的文章都是均数±标准差的形式,我不...
近日做实时荧光定量pcr,得到了不同的ct值,只是计算了△△ct以及2-△△ ct的值,但是我不知道如何使用spss进行统计分析,看到别人的文章都是均数±标准差的形式,我不知道如何这样统计。谢谢大家。
例如我有 3个组,正常组,模型组,药物组,3个基因 tnf nf-kb 以及actin内参,重复3次,这样得到27个ct值,如何统计成x±s的方式呢?以及计算p值等。谢谢。。
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例如我有 3个组,正常组,模型组,药物组,3个基因 tnf nf-kb 以及actin内参,重复3次,这样得到27个ct值,如何统计成x±s的方式呢?以及计算p值等。谢谢。。
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崔翠玲
2024-06-21
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首先你这样做出来的统计没有意义。
应该是至少3次独立实验,而不是重复3次PCR。
如果3次试验,每次重复3次(取平均值算一次)。然后先定各个基因在对照组的值为一,再算出其他组该基因的相对量,比如内参CT值一样(都是15),而TNF的CT值对照组是20,而模型组是19,则相对量是2 (对照组为1)。△△ct=(19-15)-(20-15)= -1, 2-△△ ct= 2。
以此类推。
其实你只有3组,2个基因。用ANOVA先算,然后再用t test就可以了。结果表达为TNF:对照组1, 模型组想x± d, 药物组y± d. NF-kB: 对照组1, 模型组想x± d, 药物组y± d. TNF和NF-kB间不需要比较。
请参考我发表的文章:
http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1021/bp060102e/abstract
如果你提供email, 我可以发全文给你。
应该是至少3次独立实验,而不是重复3次PCR。
如果3次试验,每次重复3次(取平均值算一次)。然后先定各个基因在对照组的值为一,再算出其他组该基因的相对量,比如内参CT值一样(都是15),而TNF的CT值对照组是20,而模型组是19,则相对量是2 (对照组为1)。△△ct=(19-15)-(20-15)= -1, 2-△△ ct= 2。
以此类推。
其实你只有3组,2个基因。用ANOVA先算,然后再用t test就可以了。结果表达为TNF:对照组1, 模型组想x± d, 药物组y± d. NF-kB: 对照组1, 模型组想x± d, 药物组y± d. TNF和NF-kB间不需要比较。
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上海精谱科技有限公司
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