On Call 36小时Ⅱ的剧情简介
医院内，每人都有自己的能力、天赋，只要大家各司其职，各安其位，无论哪一个工作岗位，都是守护别人生命的天使。
旧病复发 子妤转修病理
张一健(马国明饰)与范子妤(杨怡饰)婚后生活甜蜜，子妤更已怀孕。有一天，医院发生灾难应变，其中有伤者感染传染病，令当日负责手术的子妤被迫接受隔离，幸好最后靠病理学家洛文笙(吴启华饰)解决传染病事件。子妤虽然脱困，可是旧病忽然复发，需要接受电疗，无法保住胎儿，一健、子妤唯有忍痛决定流产。
手术完成后，子妤表面释怀，可是一健知道爱妻只是强忍伤痛。祸不单行，一健手术病人的病情突然急转直下，病人家属认为是医疗失误，向一健追究责任。一健怕子妤担心，隐瞒事件。与此同时，一健母亲黄笑莺(黄淑仪饰)发现类风湿关节炎日渐恶化。一健于家庭及工作的双重压力夹击下，焦虑指数急升。
子妤因为接受电疗而暂别医生的工作，放假疗养。期间，她反思工作与人生的目的，还因教导杨沛聪(罗仲谦饰)进行微创手术，重拾返回工作岗位的冲劲，实践医生使命。子妤为了让一健放下工作及家庭重担，明白自己的限制，开始审视身体情况，加上得到文笙的启发，终于下定决心，毅然转修病理科，重新开始。
相反，一健以为子妤面对流产及担心不能再成为外科医生，因而自暴自弃、放弃理想，于是反对子妤转修病理科。二人各持己见，冲突频生，最后两人竟然决定分开冷静……
惧见生死 文笙克服阴影
病理科专家文笙，由于年幼时目睹父母惨死，变得消极，而且害怕面对死亡。及后，文笙妻子因故身亡，为了逃避妻子的家人，文笙更毅然改修无需接触病人家属的病理科。
文笙长期失眠，于是与表妹合资开咖啡室，好让自己在晚上打发时间。一连数个夜晚，年轻女子向芊儿(朱千雪饰)不停前来打探女老板的事情，令文笙好奇。后来，文笙得悉芊儿为追寻失踪男友的下落，才四处寻找女老板的消息，决定出手帮忙，为自己百无聊赖的生活寻找乐趣。
芊儿来到慈爱医院担任实习医生，文笙眼见芊儿被男友抛弃，却仍甘愿照顾男友患有肝病的儿子郭凡星(唐子辉饰)，对她渐渐改观。可是，芊儿最终收到男友遇上车祸离世的噩耗，悲痛莫名。文笙虽然被二人的感情触动，可是依然对芊儿冷嘲热讽，以逃避内心感受。
文笙女儿希欣(庄锭欣饰)因旧病复发，在小姨孙曼月(苏玉华饰)带同下回港就医，文笙知道希欣病情，因害怕再次面对死亡，拒绝为希欣做手术，芊儿痛斥文笙，不过文笙却宁愿选择逃避。芊儿发起「捐肝行动」，为凡星寻找合适肝脏，文笙被芊儿的热诚感染，透露自己早已申请调回心脏外科，为希欣施手术。
飞来横祸 一健濒死待救
子妤在文笙带领下逐渐掌握病理科的工作，文笙带着一健参观子妤的工作成果，一健方才发现原来子妤并非自暴自弃，更开始明白每个岗位也有各自的功能与限制，得悉子妤一直以来用心良苦，终于释怀，放下那个自己无法肩负的心理重担。
正当一健与子妤和好之际，天意弄人，一健发生交通意外，要立即进行手术施救，可惜子妤不能亲自为一健动手，唯有恳求文笙操刀。然而，文笙再次犹豫，怕救不了一健。文笙能否走出阴霾，展开新生活？
