Question

SSR标记的数据构建进化树，怎么样来算bootstrap值

Answer 1

Powermarker的Bootstrap tree的输出文件是一个tree list，先保存为txt文本文件。
用记事本打开这个文本文件，再另保存为A.intree文件。
将此文件放在Phylip软件下consense程序所在文件夹中，打开consense，出现DOS界面，再输入文件名A.intree，得到两个结果文件：outree和outfile，用treeview打开outtree，得到一个树；用记事本打开outfile，可看到树上的bootstrap值。
也可以用MEGA打开outtree文件，直接可见bootstrap值。